科学技术的发展促进了学科的交叉与融合，不同学科间的领域界限越来越模糊，使得各领域间标准知识的共享与整合成为必然，而本体恰是实现此目标的关键。中医方剂学是中医诊疗理论的精华之一，将本体引入到该领域不仅是中医方剂学信息化发展的需要，更是整个中医学领域现代化、信息化发展的重要基础。为此，本课题以部分补气小方为实例，对中医方剂学本体的构建及应用进行了初步探索。　　 结合国内外本体构建方法，在包含飞教授提出的“上海中医药大学本体构建原则”的指导下，本研究通过分析中医方剂学的概念体系结构，以中医顶层本体为基础，初步建立了中医方剂本体的顶层结构。同时提出了方剂本体与其他中医子本体的融合方法，并进一步探索了方剂学概念的形式化定义。在此基础上，针对Protege在构建中文本体方面的功能限制，本课题提出了以Jena为实例导入工具，以关系数据库MySQL为存储工具，实现实例(即补气小方)的批量导入及本体的存储。通过此方法，基本完成了补气小方本体的构建。　　 构建补气小方本体之后，如何用计算机查询并推理该本体是本课题的另一研究重点。本文初步探索了利用Jena查询和推理本体的方法，并针对查询结果的精确性问题，引入了数据分析技术，探讨了本体查询限定规则的建立方法。最后，以一个简单的Java应用程序对补气小方本体做了初步的应用研究。　　 本文探讨了方剂本体从构建到应用的整个过程，并针对构建过程中出现的问题提出了解决方法，对方剂本体的开发及利用具有一定的参考和借鉴意义。