在刑事诉讼中其目的有二,一是惩罚犯罪,二就是保障人的权利不受侵犯。从本质上来说建立刑事诉讼的目的就是通过运用强大的国家机器来惩罚犯罪,以此来保障大多数人的权利不受侵犯,惩罚犯罪是保障人的权利不受侵犯的手段,而不是目的。但在刑事诉讼过程中被告人(犯罪嫌疑人)的权利却在为了保障权利的过程中往往受到来自国家机器的代表的专政机关的侵犯。刑讯逼供等严重侵犯被告人(犯罪嫌疑人)权利的现象已成为我国刑事诉讼中挥之不去的顽疾,成为严重腐蚀我国司法机体的毒瘤。随着时代的进步,人权的概念也在不断地发展,已从最初的人之所以成其为人而所具有的必不可少的权利,发展到了集体人权,民族权利,环境权等新的人权观。但在刑事诉讼中被告人(犯罪嫌疑人)最容易受到侵害的仍是平等权、生命权、自由权等基本的权利。从刑事诉讼的目的来看,保障权利是根本的,是第一位的,而惩罚犯罪只是保障权利的手段而已,它是刑事诉讼所要实现的直接目的,它在刑事诉讼的目的中只能处于第二位的位置。在刑事诉讼中以人权保障作为贯穿始终的主线,一切制度的围绕着权利的保障来设计也是刑事诉讼价值的体现。在自由和秩序这一对范畴中,虽然二者不可能处于绝对均衡的状态,甚至有时秩序会处于更重要的地位,但从整体上来说,自由是第一位的,秩序是第二位的,秩序是为自由而服务的。于其生活在没有自由的秩序中,还不如生活在没有秩序的自由中。不自由,吾宁死。权利的保障关键在制度,以人权保障作为贯穿始终的主线来设计制度,人权保障就会实现,否则人权的保障只能是一句空话。在诸制度中不被强迫自证其罪制度、非法证据的排除制度、辩护制度又是重中之重,是被告人(犯罪嫌疑人)权利保护的宪法性制度。