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[目的]本文旨在探究云南镇雄汉族、巍山回族、新疆维吾尔族人群的27个Y-STR等位基因频率和单倍型频率分布,为法医学实践应用提供数据支持,促进地区不同民族Y-STR基础数据库的建立;丰富群体遗传学基础数据,为人类遗传学研究提供相关数据参考。[方法]收集云南省公安司法鉴定中心提供的无关男性个体血液样本作为研究对象,包括云南镇雄汉族254份、巍山回族171份、新疆维吾尔族194份,应用Y filer(?)Plus试剂盒对所有样本进行27个Y-STR基因座的复合扩增,采用ABI 3500型遗传分析仪对扩增产物进行毛细管电泳分型检测,运用数据软件进行Y-STR等位基因分型;采用DISPAN、MEGA4.0等软件进行数据统计分析,分析等位基因遗传差异度和单倍型多态性,对比三个民族与其他人群的遗传多态信息,分析人群间遗传距离及遗传关系。[结果]获得了三个民族27个Y-STR基因座的基因频率和单倍型频率,云南镇雄汉族人群中,27个Y-STR等位基因频率为0.0039～0.7244,遗传差异度为0.4131～0.9548,254份样本共观察到252个唯一单倍型,1个单倍型观察到2次,单倍型多样性为0.999968877;巍山回族人群中,27个Y-STR等位基因频为0.0058～0.7207,遗传差异度为0.4314～0.9408,171份样本共观察到167个唯一单倍型,2个单倍型观察到2次,单倍型多样性为0.999862401;新疆维吾尔族人群中,27个Y-STR等位基因频率为0.0052～0.6391,遗传差异度为0.4131～0.9548,194份样本共观察到192个唯一单倍型,1个单倍型观察到2次,单倍型多样性为0.999946584;三个民族间无共享单倍型。遗传距离和系统发生树显示云南镇雄汉族人群与台湾人群间遗传距离最小(0.0046),与广西彝族的的遗传距离最大(0.0636),巍山回族人群与新疆维吾尔人群间遗传距离最小(0.0135),巍山回族人群和新疆维吾尔人群聚为一簇,与云南佤族间的遗传距离最大。[结论]本文通过对云南镇雄汉族、巍山回族、新疆维吾尔族男性样本的检测分析,获得的三个民族的27个Y-STR基因座的遗传学基础数据,具有较高的基因多态性和单倍型多态性,能够对三个民族的人群进行良好的区分,可以为法医学实践中个体识别、父系鉴定、Y-STR数据库的建立等应用提供科学依据;云南镇雄汉族、巍山回族、新疆维吾尔族人群的DYS449、DYS518、DYS570、DYS576、DYS627、DYF387S1a/b 快速突变 Y-STR 基因座 GD 值在 0.6985～0.9502,均表现出较高的遗传多态性,提示在筛选适合中国不同地域不同民族的Y-STR基因座时,可以适当选用遗传多态性较高的快速突变Y-STR基因座,使获得的遗传数据更能准确的反映人群的遗传信息特征;通过遗传距离和系统发生树对比分析,三个不同地域不同民族之间存在不同的遗传特征,镇雄汉族与台湾人群、浙江汉族人群的遗传距离较近,展现出南方汉族人群的遗传特点;而巍山回族与新疆维吾尔族人群的遗传距离最近,说明两个民族在父系遗传方面存在一定的相似性。