遗传图(geneticmap)，又称连锁图(linkagemap)，它是以具有遗传多态性的遗传标记为“路标”，以基因座之间的重组率(1％的重组率称1cM)为“图距”的基因组图。遗传图可用于筛选性状关联基因，比较相关物种之间的基因组结构，作为框架结构辅助基因组拼接。飞蝗是一种在全世界广泛分布的农业害虫，从古至今经常爆发，长期危害农业生产发展和人民生活。然而科技发展至今，蝗灾并未得到很好的控制，其中一个重要的原因是飞蝗分子生物学方面的研究并不很深入，因此覆盖全染色体的遗传图谱是非常有必要的。但由于飞蝗的基因组巨大(7.3Gb)，所以采用传统遗传图谱构建方法不可行。而限制性酶位点关联的DNA序列测序技术(RADSeq)作为一种与新一代测序技术相结合的方法，具有高通量、快速、低价、便于分析等优点，被广泛运用于遗传图谱的构建、谱系生物地理学和种群生态学的研究，及非模式生物的基因组测序等。因此本实验采用RAD测序法构建了飞蝗遗传图谱。　　我们选取了实验室种群和海南种群作为亲本。为了测试RAD所检测的SNP位点数量足够用来构建遗传图谱，首先对两个亲本进行深度RAD测序(20X)，最终得到3.7G和2.8G的数据量，分别有77％和83％的reads能比对到基因组上，比对到唯一一个位置的reads占总reads个数分别为37.39％和42.79％，只采用在全基因组唯一比对到一个位置的reads做后面的分析。最终有>5Gb的基因组序列上有snp位点。这说明RAD的方法和我们选择的种群是合适的。我们采用两个自然地理种群的杂交后代，106个体，作为作图群体。snp位点鉴定采用samtools-0.1.9pileup方法进行，总共发现了386，677个SNPs位点(丢失率<40％)。经过分离实验过滤后，有69，506个位点可以使用，覆盖了4，442，119，499bp的范围。对所有子代的个体，我们根据标记序列，把每个个体的reads分选出来。再进行纠错之后，我们获得了232，308个位点。按照孟德尔遗传规律，可以把这些位点分为父本1:1(127918)，母本1:1(73105)，1:2:1(29996)以及1:1:1:1(1289)。计算了LOD值和重组率之后，我们设LOD的阈值为8，根据LOD值把marker位点进行聚类，最终具有100个marker以上的连锁群有11个，这和蝗虫的染色体条数是一致的。在这最终建成的遗传图谱中，有15890个分子标记用于作图，相应的scaffold长度为2，785，919，512，相当于5.704个/Mb的密度。连锁群的分子标记数在178-2263个之间，标记的密度则介于4.853个/Mb-8.611个/Mb。我们最后对RAD测序法作了实验室的验证。利用Sanger测序法对随即选择的110个SNPs位点进行扩增测序后，将其与RAD法的结果对比，最终有78％的位点是相符合的。　　我们的遗传图谱首次覆盖了飞蝗这种最重要的农业害虫的全染色体，也是首次在如此大的昆虫基因组中构建遗传图谱。利用RAD测序法筛选出了386，677个SNPs位点，最终使用了15890个分子标记，这也大大超过了之前的其他遗传图。使用Sanger法验证，有78％的符合率，这说明RAD测序法构建飞蝗遗传图谱在技术上是可靠的，我们构建的遗传图谱也较为可信。但是最终分子标记的密度为5.704个/Mb，且覆盖率也不高，这是因为蝗虫的基因组巨大，且具有较高比例的重复序列。