知识经济时代的到来,使科技加速发展,技术高度融合。市场对创新的要求越来越高,技术创新的难度越来越大,单独的、甚至小范围、单层次的创新活动已经很难满足技术创新的需求。随着创新主体之间合作的纵深发展,技术创新模式逐渐由线性发展为多主体协同互动的网络模式,协同创新在创新逐步转向系统化、网络化范式的背景下应运而生。但是,与发达国家相比,我国企业的协同创新效率较低,协同发展仍然处在初级阶段。创新网络是协同创新得以平稳实现的组织平台,如何在创新网络环境中,更好地发挥创新主体的效用,从而提升协同创新绩效,是我国协同创新发展亟需解决的实际问题。本研究以创新网络为背景,以协同创新的内涵为切入点,以协同创新的运行机制及保障机制为主线,仿真或实证研究了协同创新的运行及保障过程,从而设计基于创新网络的协同创新机制。首先,通过对国内外的研究成果及文献的梳理、归纳,界定了创新网络的定义,分析了创新网络的特点,以复杂网络隐喻创新网络,构建了创新网络的拓扑结构模型。分析了协同创新的定义、特点及主体要素构成。在此基础上,分析了基于创新网络的协同创新的定义及特点。其次,论文分析了基于创新网络的协同创新动力,通过过程分析及扎根质化研究,确定了协同创新的序参量。利用自组织理论,分析了创新过程中的要素协同及主体协同机理。根据协同创新的过程及序参量,构建了基于创新网络的协同创新机制运行机制与保障机制,并剖析了协同创新不同机制的互动关系。再次,论文研究了基于创新网络的协同创新运行机制。从知识共享机制、利益激励机制以及风险管理机制三个方面,分析了协同创新的运行过程。利用超网络模型,仿真分析了协同创新的知识转移、吸收及再创造过程,构建了协同创新的知识共享机制;利用复杂网络的演化博弈模型,仿真分析了协同创新利益激励过程,构建了协同创新的利益分配机制;利用熵权法及可拓理论,建立了协同创新的风险评价模型,从风险识别、风险评估及风险控制三个方面,构建了协同创新的风险管理机制。然后,论文研究了基于创新网络的协同创新保障机制。从政府调控、金融支持以及中介服务三个方面,分析了协同创新的保障过程。利用三方演化博弈模型,分析了不同政策工具导向下的协同创新调控过程,构建了基于创新网络的协同创新政府调控机制;通过实证研究,分析了我国协同创新的金融支持现状,从金融结构、金融效率以及金融规模三个角度,构建了协同创新的金融支持机制;通过角色定位及现状分析,构建了协同创新的科技中介组织服务机制。最后,通过案例分析,对北京中关村创新网络的协同创新发展进行了分析。从中关村创新网络的知识共享机制、利益激励机制以及风险管理机制三个方面,剖析了中关村创新网络的协同创新运行情况;从政府调控、金融支持以及中介服务三个方面,剖析了中关村创新网络的协同创新保障情况。结合理论研究及现状分析,提出了完善中关村创新网络的相关政策建议。通过本文的研究,明确了基于创新网络的协同创新相关概念及特性,分析了基于创新网络的协同创新过程。从知识共享、利益激励以及风险管理的角度,构建了基于创新网络的协同创新运行机制;从政府调控、金融支持及中介服务的角度,构建了基于创新网络的协同创新保障机制。通过对我国中关村创新网络的案例分析,为基于创新网络的协同创新发展提供了决策支持。