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树突状细胞（Dendritic cell,DC）在调控机体免疫中发挥着关键作用,通过抗原递呈作用将抗原物质呈递给T淋巴细胞从而决定免疫反应和免疫耐受,并分泌多种免疫相关细胞因子调控机体免疫活动。本研究旨在分离并鉴定草鱼（Ctenopharyngodon Idellus）树突状细胞,通过转录组学技术分析从草鱼肠道中分离出的一株枯草芽孢杆菌（Bacillus Subtilis）Ch9对草鱼DC基因表达的影响,探讨草鱼DC基因表达与机体免疫功能之间的联系。主要研究内容和试验结果如下:机械法分离获得草鱼脾脏单细胞悬液,体外培养5 d后,密度梯度离心法获得一类形态上具有典型树突样突起的细胞,Transwell迁移实验发现这类细胞在LPS与嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）刺激下,迁移细胞数量显著高于对照组和益生枯草芽孢杆菌处理组（B.Subtilis）。同种异体混合淋巴反应（Mixed Lymphocyte Reaction,MLR）表明这类细胞可显著激活同种异体淋巴细胞的增殖且呈剂量依赖性。RT-qPCR法检测细胞表面标记分子CD80/86和CD83的表达,LPS刺激12 h后细胞表面标记分子CD80/86和CD83的mRNA表达水平显著高于对照组。将紫外灭活的益生枯草芽孢杆菌和草鱼DC体外共孵育,于0 h,4 h和18 h分别收集提取细胞总RNA进行转录组测序分析。以FPKM>1作为基因表达的筛选标准,512个基因在对照组中独特表达,1419个基因在益生菌处理4 h（EG4 h）组中独特表达,559个基因在益生菌处理18 h（EG 18 h）组中独特表达,361个基因在三个组中均有表达。以log2fold change≥2或log2fold change≤-2且FDR（False discover rate）<0.05作为筛选差异表达基因的标准。EG4 h组与对照组相比,2257个基因表达显著上调,1708个基因表达显著下调;EG18 h组与对照组相比,1201个基因表达显著上调,969个基因表达显著下调;EG18 h组与EG 4 h组相比,1131个基因表达显著上调,1769个基因表达显著下调。差异表达基因Go功能注释分析发现差异表达基因功能主要与免疫反应、蛋白合成转运、炎症反应和脂质代谢等相关。KEGG信号通路分析发现细胞因子与细胞因子受体相互作用通路在两个处理组中都显著地富集（p<0.05）。表明益生枯草芽孢杆菌可通过调控树突状细胞细胞因子的表达影响其免疫功能。RT-qPCR法对差异表达基因进行验证,试验结果与转录组分析结果基本一致,说明转录组测序数据真实可靠。综上所述,本研究首次分离并鉴定了草鱼树突状细胞,形态学比较和生物学功能分析的结果显示其与哺乳动物树突状细胞高度相似。转录组学分析发现益生枯草芽孢杆菌可显著上调草鱼DC细胞因子信号通路中相关基因的表达,激活草鱼DC免疫功能,提高机体免疫水平,增强对潜在病原微生物的抵御能力。