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灵芝是灵芝属(Ganoderma)的总称,隶属于真菌界(Kingdom Fungi),担子菌门(Basidiomycota),担子菌纲(Basidiomycetes),灵芝目(Ganodermatales),灵芝科(Ganodermataceae),是我国著名的药用真菌之一。四川地域特殊,生态多样,灵芝资源丰富。针对四川地区现有栽培灵芝品种不足及菌种退化的现象,本研究以从四川地区采集到的15株野生灵芝菌株为研究材料,利用ISSR分子标记和ITS序列分析对这些菌株进行遗传多样性分析和系统发育研究,在此基础上,对15株野生灵芝进行了栽培试验,对栽培过程中菌株的农艺性状进行测定,包括了菌丝生长速度、子实体性状和孢子产量以及多糖和三萜化合物含量,初步确定了下一步进行杂交育种的亲本菌株。主要实验结果如下：(1)根据ITS-PCR结果将供试菌株在0.52的相似度时聚为一类；在0.58的相似系数水平上,聚为3大类群,其中菌株G、X1和X2聚为一类,G7、H2、 H1、E3、P五个菌株聚为一类,其余菌株聚为一类。系统发育结果显示：供试菌株分别属于普通灵芝(Ganoderma Lingzhi)、赤芝(Ganoderma Lucidum)、紫芝(Ganoderma Sinense)。其中,供试菌株E3,G,P, L3,PI,P2,D,L1属于赤芝；菌株X1,G7,H1,E2,E1,H2属于紫芝；菌株X2属于普通灵芝。(2)农艺性状结果表明,就菌丝生长速度而言,x1、X2两个菌株表现较差,未长满母种试管；在栽培阶段G菌株菌丝在接种第26d长满袋子,D菌株最后满袋,需要40d。其余菌株介于两者之间。在后熟培养阶段,G菌株出现原基时间最早,为接种后第32d,E2、E3最晚,为44d,其余介于两者之间。对子实体重量和孢子产量进行统计分析,结果表明菌株G的产量最高,平均22.1g；产量最小的出自H1菌株,为平均8.9g。头潮生物转化率也是G菌株最高,为平均5.12%,最低为H1,为平均3.09%。子实体产物测定结果表明：菌株P2的灵芝多糖含量最高,为1.61%,含量最低的为E1,为0.76%。同时G菌株的灵芝三萜含量最高,L1最低,为2.85。G、G7、P2和X1四个品种的灵芝三萜含量较高。综合遗传距离和农艺性状互补的原则初步筛选出P2、P、G7和E3四个野生菌株作为下一步遗传育种的亲本材料。