柑橘衰退病毒外壳蛋白与褐色橘蚜互作蛋白的筛选与鉴定

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由柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)引起的柑橘衰退病是世界上最具经济重要性的柑橘病害之一,已对全球多个柑橘产区造成了严重的经济损失。CTV主要通过嫁接和和蚜虫以半持久的方式进行传播,而褐色橘蚜(Aphis citricidus)是我国CTV最重要的传播媒介,其传毒能力最强,能够有效传播CTV的大多数株系。为此,探索CTV与褐色橘蚜的互作机制,对于深入了解CTV的蚜传机理,防控柑橘衰退病具有重要意义。本研究基于已有研究结果,分别构建了褐色橘蚜头胸部总RNA的核系统和膜系统酵母文库,并以CTV的主要外壳蛋白(CP)、次要外壳蛋白(CPm)为诱饵,利用酵母双杂技术筛选出可能与CTV CP和CPm互作的褐色橘蚜蛋白,并进行初步验证。同时,通过对无毒、获毒和获毒后失去传毒能力的褐色橘蚜进行蛋白组学测定、生物信息学分析,再结合酵母双杂实验结果进行关联分析,初步筛选、鉴定出褐色橘蚜中与CTV外壳蛋白互作的蛋白。从而为揭示褐色橘蚜传播CTV的传毒机制提供数据基础,进而为CTV的防治提供新的思路。主要研究成果如下:1.利用褐色橘蚜头胸部总RNA构建褐色橘蚜核系统酵母文库,该c DNA文库的滴度为4.5×10~8cfu/m L,重组率为95.6%,符合高质量c DNA文库的要求,可用于后续的筛库试验。将CTV的CP和CPm基因分别插入到诱饵载体质粒p GBKT7-BD,构建了对酵母细胞无毒性且无自激活活性的诱饵质粒p GBKT7-CP和p GBKT7-CPm,进而通过mating法,运用诱饵质粒筛选核系统文库。结果诱饵质粒p GBKT7-CP筛库得到2种蛋白,p GBKT7-CPm筛库得到23种蛋白。将p GBKT7-CP筛选到的2种蛋白circadian clock-controlled protein-like(Cir)和pre-m RNA-processing factor 40 homolog B isoform X1(Pre)以及从p GBKT7-CPm筛选到的23种蛋白中选取的3种蛋白Argonaute 1 region 1(Ago)、Actin(Act)和ubiquitin(Ubi)分别与相对应的诱饵蛋白共转化酵母进行二次互作验证。结果表明,Cir和Pre均能与p GBKT7-CP互作,Ago也可与p GBKT7-CPm互作,而Act和Ubi与p GBKT7-CPm均不互作;2.利用褐色橘蚜头胸部总RNA构建褐色橘蚜膜系统酵母文库,该文库库容为3.6×10~6cfu/m L,重组率为100%,可用于后续筛库。比较Split-ubiqitin膜酵母双杂交系统的诱饵载体质粒p BT3-N、p BT3-STE和p DHB1发现,p DHB1可用于构建分别含有CP和CPm基因,没有自激活性且通过功能验证的诱饵质粒p DHB1-CP和p DHB1-CPm。进而从膜系统酵母文库中分别筛选到55种和17种蛋白。选取23种p DHB1-CP筛选到的蛋白以及p DHB1-CPm筛选到的17种蛋白分别与相对应的诱饵蛋白共转化酵母进行二次互作验证。结果表明,除protein bric-a-brac 1(Pro1)和RNA-binding protein squid-like isoform X2(Rbp X2)外,CP与其它21种猎物蛋白均能发生互作;除uncharacterized protein LOC114129262(LOC262)、uncharacterized protein LOC114122708(LOC708)和PREDICTED:voltage-gated potassium channel subunit beta-2 isoform X1(Vol)外,CPm与其它14种猎物蛋白均能发生互作。3.利用基于质谱检测的标记的串联质量标签(Tandem mass tags,TMT)定量技术对无毒、获毒、获毒后失去传毒能力的三组褐色橘蚜头胸部的蛋白分析表明,获毒蚜虫组相比无毒蚜虫组(DD/WD)共有517个差异表达蛋白,获毒蚜虫组相比获毒后失去传毒能力的蚜虫组(DD/QSHWD)共有344个差异表达蛋白,获毒后失去传毒能力的蚜虫组相比无毒蚜虫组(QSHWD/WD)共有1259个差异表达蛋白。对比DD/WD与DD/QSHWD各自之间的差异表达蛋白,去除未表征蛋白后,一共有47种共同差异表达蛋白(CDEPs)。CDEPs主要富集在5条通路:淀粉和蔗糖代谢、线粒体自噬、光转导、精氨酸和脯氨酸代谢、三羧酸循环。4.将酵母双杂交技术和TMT定量技术这两种方法的结果进行对比发现,两者有一个相同蛋白:钙离子转运ATP酶/Ca2+泵(Calcium-transporting ATPases,Cal)。
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