2009年新医改公布的《关于深化医药卫生体制改革的意见》中指出医疗改革的目标之一是实现“社区首诊、双向转诊、急慢分治、上下联动”的就医模式。2016年3月14日的两会报道中再次提出“积极推行双向转诊制度,进一步解决‘大医院资源供给不足,社区医院资源利用不高’的问题”。双向转诊已经成为解决当前医疗问题的主要途径。医疗卫生改革正不断深化,建立协议合作模式的医疗机构双向转诊是现阶段实现医疗资源整合、促进各类医疗机构合理分工的重要可行手段。上海实施协议合作模式的的双向转诊,缓解了综合医院人满为患的压力,提高了患者的就诊效率,实现了医疗资源更加合理的利用,在一定程度上解决或者缓解了当前就医难的问题。但是仍然存在着“上转容易下转难”单向诊疗局面、转诊流程不通畅等问题,从而使得双向转诊的实施并未达到预期效果。论文就是通过分析当前双向转诊中存在的主要问题,研究制约其发展的主要因素,找出优化双向转诊良性运行的途径,从而确保双向转诊的实质性运行。论文主要是对上海协议合作模式下的双向转诊进行研究,在文献研究的基础上,采用调查法、实证研究法、层次分析法、灰色关联分析法、结构方程模型等方法进行深入分析,以确保研究结果的全面和准确。文章首先对双向转诊的相关概念以及理论进行界定和分析,并在分析协议合作模式下双向转诊的现状的基础上,总结了当前实施过程中存在的问题以及导致这些问题的原因;其次,在选取患者满意度、转诊率作为双向转诊评价指标的基础上,分别采用灰色关联分析法、层次分析法对两个目标的影响因素进行分析;再次,在理论研究的基础上,提出相关的假设,通过构建假设模型,采用结构方程模型进行相关的实证分析;然后,从国外、国内双视角下,分析国内外不同的做法并进行经验借鉴;最后,根据理论和实证分析结果,提出优化协议合作模式下上海医疗机构双向转诊的对策和建议。通过研究得出,提高患者满意度有助于促进转诊率的提高,因此加强双向转诊的数量控制和质量管理,是促进双向转诊良性运行的有效途径。通过良好的有序就医实现医疗资源的合理有效利用,最终促进医疗服务更好地惠及广大人民群众。