系统分析MicroRNA调控介导的靶基因功能异质性

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MicroRNA是一类非编码的微小RNA,广泛参与调控细胞分化、增殖、凋亡等多种与疾病密切相关的生物学过程,是多种人类复杂疾病尤其是肿瘤形成与发展的重要调控因子。随着系统生物学的发展,研究人员对于microRNA调控作用的深入研究,micorRNA靶基因的许多属性和功能得到了广泛关注。已有的研究发现一些受microRNA调控的靶基因具有高进化保守性,还有一些靶基因在网络中的分布具有成簇性,也发现靶基因是否受microRNA的调控具有选择性。这些研究表明microRNA的靶基因是一类具有特殊功能属性的基因集,他们的具体功能是目前实验研究的热点,然而这类基因与非靶基因是否具有区别,它们的共有属性是什么尚未被发现。本文从这点出发,研究了microRNA调控的靶基因在互作网络中的拓扑属性,更深一步研究了靶基因所富集的生物学功能和参与的生物学通路,通过这三个方面的研究对microRNA靶基因集进行系统的功能组学分析。结果表明,受microRNA调控的基因在组织中的分布更为广泛,在调控网络中具有成簇性以及更可能成为hub结点,与非靶基因相比参与了更多生物学过程,并且更可能参与癌症相关通路,表明microRNA靶基因是一类特殊基因,其功能属性与非靶基因显著不同,在许多生物学过程中扮演重要角色。本研究对揭示microRNA对基因的调控机制具有重要意义。
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