节节麦穗型遗传研究

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节节麦(Aegilops tauschii Coss.)属禾本科(Poaceae)小麦族(Triticeae)山羊草属(Aegilops L.),是小麦的D基因组供体。节节麦依据形态学划分成两亚种(ssp.strangulata和ssp.tauschii)及三个变种(var.typica、var.anathera、var.meyeri),依据基因型划分成L1(lineage 1)和L2(lineage 2),两种划分类型结果并不完全一致。通过基因型对节节麦进行分类比单纯的形态学分类更能体现出节节麦的遗传差异。SI值(颖壳宽度与小穗轴段上部宽度的比值)被证实是反映节节麦种内差异的一种亚种指数,根据SI值能将节节麦穗型划分成S型(ssp.strangulata型)、T型(ssp.tauschii型)和I型(中间型)。本研究以SI值作为划分节节麦穗型的形态指标,结合全基因组SNP芯片数据以及构建的分离群体,探讨节节麦亚(变)种归属及穗型分化相关的SNP位点。主要结果如下:1.全基因组SNP数据与SI值聚类分析均将237份节节麦分成两大类,即S型与I型为一类,T型为一类。以SI值为表型数据,全基因组关联分析获得5个与穗型显著关联的SNP位点。5个SNP位点分别位于1D(85.514c M,变异率为4.73%)、2D(73.485c M和214.096c M,变异率分别为4.49%和4.42%)、4D(132.198c M,变异率为6.57%)、7D(152.246c M,变异率为4.43%)。其中在4D上SNP位点解释的表型变异率最高,与穗型极显著关联。2.亚种间的18个杂种F1与双亲的SI值均有显著差异,且更偏向于杂交父本。正反交F1间的穗型及SI值差异不显著,表明节节麦穗型不受母性遗传的控制,但不排除有核质互作的可能。3.亚种间F2群体的SI值呈正态分布,这表明节节麦穗型性状属于数量性状。极端单株混池测序分析表明4D上可能存在影响穗型的主效位点。
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