作为现代社会中最重要的组织机构之一,高等院校的社会职能己经超越了教育与科研,与社会经济发生了难以割裂的联系,服务市场逐渐成为高校第三职能。高校职能的实施状况,及其与产业部门等其他社会组织之间的联系,对于一个国家的创新能力和可持续发展具有举足轻重的影响。中国高校能否充分发挥自身的作用,对于面临工业化和知识化双重挑战,实施和平崛起战略的中国尤为重要。但迄今国内学术界尚缺乏专门而系统的研究。本论文从高等院校在建设创新型国家中的地位和作用入手,以纵向历史考察为经:高等院校提供教育和培训,因而天然地成为国家创新体系中的一个主体,20世纪以后,某些内在与外在因素的共同作用使得高等院校以更复杂的方式参与国家创新系统成为必然一高等院校不仅是创新系统中作为基础研究提供者的学术界的典型代表,而且通过与产业界的互动所形成的复杂网络日益深入地参与到国家创新系统中;以横向比较分析为纬:对比国外高等院校在国家创新系统中的地位与作用,结合我国的实际情况,对我国高等院校在国家创新系统中的职能及其与其他主体的关系问题进行了归纳分析。在此基础上提出若干政策建议:重构国家创新系统中各主体的关系,建立多元化的高等院校体系,正确处理高校直接涉足经济活动、创办并运营企业的独特现象,培育风险资本市场,大力建设催生衍生企业的环境等。