动脉粥样硬化的潜在预测靶点:原肌球蛋白2(Tropomyosin 2,TPM2)

来源 :卫生部北京老年医学研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:caibh
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随着我国经济高速发展导致生活方式的改变和人口老龄化的加剧,动脉粥样硬化问题也越来越严重。心脑血管疾病(Cardiac-cerebral vascular disease,CCVD)主要由动脉粥样硬化引起,是导致死亡的主要原因。动脉粥样硬化性心血管疾病(atherosclerotic cardiovascular disease,ASCVD)占CCVD的大部分,发病率和死亡率在我国逐年升高。因此,该问题引起全世界大多研究者的关注。许多研究已经调研并试图阐明动脉粥样硬化的分子机制,但其发病机制尚未完全阐明。GSE43292和GSE57691两个表达谱数据集来自于基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库。本研究鉴定了动脉粥样硬化与正常动脉之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其进行了功能注释、富集分析、蛋白-蛋白互作分析、核心基因的挖掘与鉴定等。进一步构建动脉粥样硬化的动物模型和神经网络预测模型,验证核心基因与动脉粥样硬化的关系。本研究在正常和动脉粥样硬化样本中共鉴定了234个DEGs,其主要富集于肌动蛋白丝、肌动蛋白结合、平滑肌细胞和细胞因子-细胞因子受体的相互作用。共有13个基因被鉴定为核心基因。经过动物模型验证,在公共数据集和验证数据集中发现一个共同的差异表达基因:原肌球蛋白2(Tropomyosin 2,TPM2),其在动脉粥样硬化样本中的表达水平较低。神经网络模型预测得出,TPM2与动脉粥样硬化的发生发展有着紧密的相关性和预测价值。总之,本研究中发现的DEGs可能有助于临床医生了解动脉粥样硬化发生发展的发病机制,而TPM2可能作为动脉粥样硬化诊断和治疗的生物标志物。
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