中国人群线粒体单体群及基因变异与2型糖尿病的相关性研究

来源 :温州医学院 温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:junlintianxiap
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
2型糖尿病是一种复杂的内分泌代谢疾病,其以胰岛素抵抗为主,伴胰岛素分泌不足引起的以持续性血糖升高为特征,临床上表现三多一少,即多饮、多食、多尿和体重减少。随着社会经济的发展,生活水平的改变,糖尿病的发病率正逐年升高,其已成为继恶性肿瘤,心脑血管疾病后的第三位严重危害人类健康的重大疾病。有效的对糖尿病进行防控是全人类面临的重大难题。   由于该病的发生发展与遗传因素和环境因素均有密切关系,其发病机制目前尚未明确。因此,开展2型糖尿病相关分子致病机制的研究对2型糖尿病尤其是其并发症的早期预防、早期诊断、早期治疗具有重大的指导意义。   线粒体DNA突变及功能缺陷与2型糖尿病发病密切相关。线粒体的位点突变会导致线粒体结构、功能和基因表达的改变,与线粒体生物能量合成和能量代谢的缺陷密切相关;而线粒体单体群的不同提示在不同遗传背景下,个体患2型糖尿病的风险不同,可能是2型糖尿病患病的分子基础。虽然已有的研究发现线粒体DNA变异及单体群与2型糖尿病发病相关,相关突变位点包括:A3243G,T16189C,C1310T等;相关单体群包括:N9a,D4,B4等。但目前,在不同单体群的遗传背景下,线粒体基因变异与2型糖尿病发病相关研究还未见报道。   因此,本研究以T2DM线粒体单体群及基因变异为切入点,通过建立浙江省汉族人群2型糖尿病及对照样本标准化资源库和数据库,了解中国浙江温州地区汉族人群2型糖尿病线粒体突变相关易感和保护基因及其常见突变方式,探讨2型糖尿病易感的单体群及相关基因变异的分子致病机制,并在此基础上,联合分析2型糖尿病线粒体单体群的不同遗传背景和相关基因变异的相互作用,尤其是罕见变异和单次变异对T2DM的发病影响,为临床上2型糖尿病及其并发症的预警、诊断和治疗提供科学的理论依据和技术指导。本研究主要分为以下两部分内容:   第一部分浙江省2型糖尿病与对照样本的标准化资源库建设   此部分研究旨在建立覆盖浙江省全省的2型糖尿病与对照样本标准化资源库,该标准化资源库包含以下具体内容:①受试者知情同意书;②受试者(及其家属)基本资料表等;③受试者(及其家属)入院资料、体格检查结果、检验相关指标等临床资料;④受试者(及其家属)外周静脉全血样本;⑤受试者(及其家属)全基因组DNA样本;⑥受试者(及其家属)基因检测结果;⑦部分重点家系的永生细胞株。目前为止,该资源库共纳入2型糖尿病患者4586例,非糖尿病对照2247例。   利用建立的2型糖尿病标准化资源库,对现有2型糖尿病患者临床发病情况、并发症情况、遗传方式以及基因变异进行初步地分析。这些工作的完成不仅仅可以永久保存宝贵的糖尿病遗传资源,为今后进一步深入开展科研及临床工作奠定了良好的基础。同时,也为2型糖尿病及并发症的遗传危险因素评估提供理论依据,尤其是为筛查出的线粒体糖尿病患者及其家属提供遗传咨询、婚配指导和疾病预警的相关建议,实现2型糖尿病的早期诊断、干预和治疗,有效降低T2DM的并发症的发生。   第二部分中国汉族人群线粒体单体群及基因变异与2型糖尿病的相关性研究   目的:   研究浙江温州地区汉族人群线粒体单体群、基因突变及其相互作用与2型糖尿病的关系   方法:   1.样本收集纳入:共纳入温州医学院附属第一医院内分泌科的汉族T2DM患者301例;非糖尿病对照组样本403例来自温州医学院附属第一医院体检中心。详细准确记录各组样本临床基本情况及相关指标。   2.基因扩增:通过提取受试者外周血基因组DNA,采用PCR技术扩增线粒体全基因组序列后,直接送公司测序。   3.序列比对分析:将测得的DNA序列与修正剑桥参考序列通过Condoncode Aligner软件进行比对,查找变异位点;再对变异后氨基酸的改变进行分析;并应用PolyPhen2网站对氨基酸改变对蛋白质功能影响预测分析,同时应用Clustal X软件分析氨基酸的保守性;另外,根据mtDNA变异位点,结合mtiomap网站和HaploGrep网站进行线粒体单体群分型。统计分析T2DM组与对照组中线粒体单体群的分布差异,及不同单体群中不同类型mtDNA变异在T2DM和对照组中的分布差异。统计学分析均采用SPSS16.0软件进行:计量资料采用t检验;计数资料采用x2检验和Fisher精确概率法检验。   结果;   1.本研究病例对照样本中,2型糖尿病组在BMI、收缩压、空腹血糖、低密度脂蛋白等指标水平均显著高于非糖尿病对照组,经t检验P值均小于0.05,有显著统计学差异。   2.本研究纳入人群单体群分布如下: D4(13.90%)、D5(8.19%)、M7(8.93%)、M8a(1.74%)、M9(2.23%)、M10(1.99%)、M12(0.50%)、G(2.73%)、C(3.72%)、Z(3.72%)、N9a(3.47%)、A(6.70%)、R9(16.63%)、R11(1.74%)、B(20.35%)和Y(0.74%)等为我国相对多见的单体群。其中M8a(OR=3.032;95%CI,1.215-7.563; P=0.013)、Z(OR=0.233;95%CI,0.066-0.820; P=0.014)和N9a(OR=2.388;95%CI,1.169-4.874; P=0.015)3种单体群在T2DM和对照组间的分布有统计学差异,提示M8a、Z和N9a这3种单体群可能与T2DM的发病风险密切相关。M8a和N9a患糖尿病的风险为其他单体群的3.032和2.388倍,为T2DM的易感人群;而Z患糖尿病的风险仅为其他单体群的0.233倍,降低了T2DM的患病风险。   3.线粒体基因组DNA经测序发现,在301例T2DM患者中,共检测到1169种变异,其中点突变1135种,缺失11种,插入23种。403例对照样本中,检测到1397种变异位点,其中点突变1353种,缺失12种,插入32种。经x2检验,T2DM组中的线粒体基因缺失率显著高于对照组,OR=1.255;95%CI,1.041-1.513; P=0.017,提示线粒体的基因缺失可能是T2DM的危险因素。   4.将T2DM组和对照组中所有的线粒体基因变异比较分析,x2检验发现,共有21个突变位点在2组中的分布具有显著统计学差异,其中包括20个点突变和1个基因缺失。包括位于线粒体基因D-loop、ND5、ATP6、COⅠ、ND6、COⅢ、ND2等基因变异523delAC(OR=3.308;95%CI,2.268-4.826; P=0.000)、T16519C(OR=2.604;95%CI,1.939-3.498; P=0.000)、G12372A(OR=2.481;95%CI,1.317-4.674; P=0.004)、C8684T(OR=3.176;95%CI,1.290-7.820;P=0.008)、G6179A(OR=3.176;95%CI,1.290-7.820; P=0.008)、G16473A(OR=5.474;95%CI,1.154-25.968; P=0.016)、C194T(OR=3.784;95%CI,1.193-12.001; P=0.016)、C16184T(OR=2.772;95%CI,1.170-6.565; P=0.016)、T14470C(OR=2.621;95%CI,1.152-5.963; P=0.017)、C12705T(OR=1.460;95%CI,1.070-1.991; P=0.017)、C9296T(OR=4.110;95%CI,1.103-15.312;P=0.023)、G5417A(OR=2.140;95%CI,1.097-4.176; P=0.023)、C8964T(OR=3.428;95%CI,1.065-11.037; P=0.028)、G8020A(OR=2.554;95%CI,1.006-6.480; P=0.041)和A4833G(OR=2.206;95%CI,0.987-4.933; P=0.049)等15个基因变异可能增加了T2DM的发病风险;而基因D-loop、CYB、COⅠ、ATP6上的T16271C(P=0.006)、T15784C(OR=0.162;95%CI,0.037-0.709;P=0.006)、C16185T(OR=0.258;95%CI,0.087-0.763;P=0.009)、A6752G(OR=0.229;95%CI,0.066-0.787; P=0.011)、T9090C(OR=0.280;95%CI,0.080-0.982; P=0.034)、C16291T(OR=0.389;95%CI,0.154-0.982; P=0.039)等6个变异则降低了T2DM的发病风险。上述位点仅有2个位点为错义突变,但保守性分析显示该2个位点保守性差。   5.在M单体群和N单体群中,线粒体上所有常见基因变异(MAF≥5%)在T2DM组和对照组中分布无差异,提示线粒体常见变异可能与T2DM的发病无关,仅为物种进化中的适应性SNP。   6.在M单体群下,T2DM组线粒体基因CytB、ND1和ND3的低频变异(1%≤MAF<5%)少于对照组中的低频变异;而在N单体群中,T2DM组则是线粒体基因tRNA的低频变异少于对照组中的低频变异。   7.在M单体群下,T2DM组线粒体基因D-loop、CytB、ND5和COⅡ的罕见变异(MAF<1%)显著高于对照组中的罕见变异,提示D-loop、CytB、ND5和COⅡ的罕见变异可能是2型糖尿病发病的危险因素;而N单体群下,T2DM组则是线粒体基因COⅡ和ND1的罕见变异显著高于对照组中,提示COⅡ和ND1的罕见变异可能是2型糖尿病发病的危险因素。   8.对比分析单体群M和N中单次变异(在所有样本中仅出现一次)的分布情况,各基因在M和N中的累计变异基本分布一致。但COⅢ的单次突变给N单体群人群增加了T2DM的患病风险,而非M单体群T2DM的危险因素;而CytB和COⅡ的单次变异与M单体群人群T2DM发病相关;ND4的单次变异则与N单体群人群T2DM发病相关。   9.统计罕见变异中的错义突变,T2DM组和对照组间无差异。分别针对各个编码基因进行分析,基因CytB(OR=2.225;95%CI,1.443-3.489; P=0.000)、ND5(OR=1.925;95%CI,1.122-3.303; P=0.016)和ATP6(OR=1.813;95%CI,1.041-3.159; P=0.034)中罕见错义突变在T2DM组显著高于对照组,可能增加了T2DM的患病风险;且发现ND1的L181M(2例)、ND4的N138S(2例)、ATP6的G16S(4例)和A177T(2例)这4种具有破坏效应的突变仅在T2DM组出现,且ATP6的G16有保守性好。   结论:   线粒体单体群为浙江温州地区汉族人群T2DM发病的分子基础,不同单体群背景联合不同mtDNA基因变异对T2DM发病的分子作用不同。且线粒体基因常见变异大多为SNP位点,罕见变异和单次变异可能才是线粒体基因变异影响T2DM发病风险的分子基础和关键所在。
其他文献
目的:通过抑制NLRP3炎症小体,观察坐骨神经慢性压榨性损伤(chronic constriction injury,CCI)模型大鼠机械痛敏变化,探讨NLRP3炎症小体对神经病理性疼痛的影响及机制。方法:S
目的:通过检测急性冠脉综合征(Acute Coronary Syndrome,ACS)患者血浆骨保护素(OPG)、血浆N末端前钠尿肽(NT-ProBNP)水平,研究血浆OPG、NT-ProBNP的变化与斑块稳定性及冠状动脉病变程
目的:评价液基细胞学检查、高危型HPV检测、阴道镜检查及镜下多点活组织病理检查的对CIN3诊断的应用价值,探讨CIN3的最佳治疗方式,以期更好的指导临床诊治。   方法:回顾性
第一部分食物与食欲相关fMRI研究的Meta分析   目的:确认大脑功能区对食物刺激反应的一致性,借以探讨中枢对饥饿状态及含不同热量食物反应的调节机制。方法:应用SDM体素Met
目的:研究原因不明性复发性流产(URSA)患者外周血中T细胞亚群及Th1/Th2型细胞因子水平的变化;以及URSA患者再次妊娠时T细胞亚群、Th1/Th2型细胞因子的变化与不同妊娠结局的关
目的:通过使用更加客观的指标,探讨凝胶减压垫在预防困于轮椅的老年人坐骨结节压疮中的作用及这一人群更换体位的较好时间。方法:采用自身前后对照试验设计,以32名需要使用轮
目的:比较帕瑞昔布和右美托咪定超前镇痛在全膝关节置换术(Total kneearthroplasty TKA)的术后镇痛作用,为临床选择镇痛方案提供依据。  方法:选择2012年2月-2013年3月徐州医
目的:探讨辅助生殖助孕(ART)双胎与自然双胎的妊娠期相关并发症、围产儿结局及高龄对辅助生殖双胎组妊娠结局、围产儿结局的影响,为降低辅助生殖技术助孕的孕产妇围产期并发
目的:急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)是一种临床危重症。AKI发病率高、死亡率高,同时也是慢性肾脏病的重要危险因素,长期以来严重威胁着人们的生命健康。及早诊治AKI对
目的以磁共振成像为参照,探讨高频超声对血友病性关节病的特征。方法收集44名血友病患者中70例膝关节行超声检查,其中11名小于18岁的血友病患者中16例膝关节完成磁共振成像(M