人类基因C4orf13、CDK5RAP1_v3、CDK5RAP1_v4和PXK的克隆和功能研究

来源 :中南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:h563268898
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
从大规模的胎脑组织cDNA克隆和测序计划中,本文通过生物信息学分析选取了4条全长cDNA进行进一步的研究,以探讨这些基因的功能及其与人类疾病的关系。 分离到的人类新基因C4orf13cDNA全长2706bp,编码一个340氨基酸的多肽,其含有一个典型的SBF结构域(SBF,SodiumBileacidcotransporterfamily)和十个可能的跨膜区段。假定的蛋白C4orf13显示了与在大鼠和非洲爪蟾中同源蛋白高度的相似性。人类基因C4orf13定位于染色体4q31.2并含有12个外显子。RT-PCR结果表明人类基因C4orf13在成人组织中广谱表达,其中在肝脏和肺组织中的表达水平相对较高,在胎盘、肾脏、脾脏和胸腺组织中的表达水平居中,在心脏、前列腺和睾丸组织中的表达水平较低。表达谱芯片结果显示人类新基因C4orf13在胃癌组织中表达显著上调。 两个人类基因CDK5RAP1新的剪切体,CDK5RAP1_v3和CDK5RAP1_v1被成功地从胎脑文库中克隆出来。CDK5RAP1_v3和CDK5RAP1_v4的cDNA分别长1923bp和1792bp。序列分析表明CDK5RAP1_v4相对CDK5RAP1_v3缺少了一个外显子,这导致这两种cDNA编码不同的蛋白。推断的蛋白分别含有574个氨基酸(CDK5RAP1_v3)和426个氨基酸(CDK5RAP1_v4),它们具有共同的N-端420个氨基酸残基。RT-PCR分析的结果显示人类CDK5RAP1_v3广泛地在成人组织中表达。CDK5RAP1_v3的表达水平在胎盘和肺组织中相对较高,而在心脏、大脑、肝脏、骨骼肌、胰脏、脾脏、胸腺、小肠和外周血淋巴组织中表达水平较低。相对来说,CDK5RAP1_v4主要在大脑、胎盘和睾丸组织中表达。 PX(Phoxhomology)结构域特异性地与磷脂酰肌醇脂质结合,这一结合对于它们的细胞功能是关键的。一条全长的人类PXK基因(humanPXdomaincontainingserine/threoninekinasegene)cDNA以前曾经被克隆出来,本文将其命名为PXK_v1。PXK_v1含有一个S_TKc结构域(serine/threoninekinases,catalyticdomain),但是缺少了几个对于催化活性绝对必要的几个氨基酸残基。目前的研究表明在人类胎脑组织中至少存在人类PXK基因四种其它的不同剪切体,将其分别命名为PXK_v2,PXK_v3,PXK_v4及PXK_v5。RT-PCR结果显示了人类PXK_v1,PXK_v2及PXK_v4转录本在成人组织中除了心脏之外广泛表达。相对地,PXK_v3转录本仅仅在外周血淋巴组织中低水平表达而PXK_v5转录本不能被检测到。将PXK_v1或PXK_v2基因的读框克隆入pET32a载体,在大肠杆菌Rosette(DE3)菌株中获得表达后我们纯化了蛋白。对PXK_v1或PXK_v2的激酶活性测定中未检测到酶活性。序列分析结合酶活测定,本文推测PXK蛋白为假激酶。EGFP-PXK融合蛋白在COS7细胞中的亚细胞定位分析表明PXK_v3具有与其它PXK蛋白异构体不同的亚细胞定位。根据在COS7细胞中突变分析EGFP-PXK_v1的亚细胞定位结果,推断PXK_v1-Tyr56与Arg92对EGFP-PXK_v1在COS7细胞的亚细胞定位中发挥了关键作用。过表达试验表明,PXK基因五种剪切体对COS7细胞的增殖有不同程度的影响。此外,PXK基因五种剪切体在COS7细胞内过表达均能促进细胞的凋亡。采用酵母双杂交系统寻找与PXK_v1或PXK_v2相互作用的蛋白,未筛选到激酶与之相互作用,但本文发现PXK_v1或PXK_v2蛋白均可与PPP1R7蛋白相互作用,这为进一步揭示PXK蛋白的功能提供了依据。
其他文献
功率半导体器件和功率集成电路是半导体产业的重要分支,功率整流器件是功率半导体器件的重要组成部分,各种功率整流器件广泛应用在人们的生活和生产中,包括了太阳能、通讯、汽车、电力传输和家用电器等领域;功率整流器件朝着低功耗和低成本方向发展,要求更低的正向开启电压和正向导通电阻、更高的电流密度及更快的反向恢复时间。发展器件的新理论和新结构,可以优化整流器件的各项电参数特性,满足功率整流器件的发展要求。本文
AVS(Audio and Video coding Standard)是中国具有自主知识产权的第二代音视频编解标准,为中国日渐强大的音视频产业提供完整的信源编码技术方案。由于其采用了先进、自主的
期刊
近年,在人工智能快速发展的大背景下,涌现了大量高精度,高分辨率的图像识别算法。这些算法应用在例如安防监控,先进辅助驾驶系统和自动化制造等不同领域。AdaBoost人脸检测就是其
仙茅(Curculigo orchiodes Gaertn.)作为传统中药材具有重要的医学价值,近年来的需求量与日俱增,但由于其自然生长和繁殖速度慢,加上长期过度被采挖,野生资源日趋减少。本研究应用组织培养技术首次建立了有效的仙茅人工快繁体系,对其愈伤组织的诱导和形态发生过程进行了细胞组织学鉴定,并通过对体细胞核型分析、仙茅苷含量的比较测定确定组培苗的遗传稳定性,为仙茅的组织培养技术应用于生产提供
  金藻因为营养价值丰富和能形成赤潮或水华,而广受学术界和政府部门的关注。目前我国的金藻分类一直沿用20世纪70~80年代的分类标准,以形态特征为主。由于传统的分类方法
我们先来看一下山东省临沂市2008年中考数学试卷的第25题:rn题目 已知∠MAN,AC平分∠MAN.rn(1)在图1中,若∠MAN=120°,∠ABC=∠ADC=90°,求证:AB+AD=AC.
期刊
野生大豆可以在相对较严重的盐碱地环境下生长,说明在野生大豆中存在着耐盐和耐碱两套机制,是研究植物盐、碱胁迫生理机制的理想材料。目前对于植物盐胁迫生理和分子机制的研
在现代无线通信系统应用中,为了获得更高的数据传输速率,信号包含多路相位和幅度多变的副载波,导致信号峰均比(PAR)很高。为了满足系统对线性度很高的要求,功放必须能够产生
在历年的中考试题中,求三角函数值是一个热点.现以中考试题为例,说明求三角函数值的常用方法.rn一、运用定义求三角函数值rn例1(2019·眉山)如图1,在Rt△ABC中,∠B=90°,AB=5
期刊