高等院校是非营利组织的重要组成部分，是国家培养各种人才的重要场所。从1999年以来，中国高校进入了快速发展期。高校的数目不断增多，高校的场地逐渐扩建，高校的规模也不断扩大，形成了许多在校生超过上万人的大型组织，经济活动和运作方式日渐复杂。然而，高校的内部控制并没有随着学校的扩张而取得同步发展，甚至仍处于较低级、极易受忽视的阶段。近年来，高校的贪污受贿案件时有发生，高校的财务危机、经营风险更是不断引起人们的热议。而高校贪污受贿案件与经营危机都与高校的管理不利有极大的关联性，管理失控、监督失力引发各种问题，增大了高校运作的风险，高校应该对内部控制环境引起足够的重视。因此，积极采取措施改善高校的内部控制环境是高校全体教职员工义不容辞的责任。论文主要运用访谈法、文献法和分析归纳法，从企业内部控制的视角，对高校内部控制进行理论论证和实践调查，深入探讨高校的内部控制环境这一要素。首先，引入成本控制论、风险管理理论作为全文的理论基础。高校是一个复杂的组织机构，其运行的效率就体现在教职员工的工作效率、高校的管理效率以及对外部环境和内部环境的适应性等方面；高校的风险体现在高校人力资源风险、高校设施运行风险管理、高校财务风险管理等方面。尽管高校是非盈利性组织，但是高校运营离不开资金的支持。财务制度和监控方面存在的漏洞也使得贪污腐败事件时有发生，严重损害了国家和集体、广大师生的利益。建立自律与他律相结合的内部控制环境十分重要。然后，选取了数名具有代表性的高校教师、行政管理人员、在校学生做深度访谈。访谈结果表明高校教师对构建和改善高校内部控制环境的一致肯定。在此基础上，通过运用企业内部控制理论，根据访谈记录对高校内部控制环境的现状进行分析，得到了目前我国高校内部控制环境方面普遍存在的问题有：高校缺乏内部控制意识，组织机构设置不合理，人力资源政策不健全，缺乏节约成本的意识，缺乏风险控制的意识，内部审计监督失效。最后，经过调查结果分析高校内部控制环境存在的问题，提出促进及改善高校内部控制环境的策略。要加强内部控制，需要对原有的环境进行改造，构建一个新的“内部控制”氛围，重视人和环境的相互影响。借鉴企业界对于内部控制环境的研究，提出高校改善良好的内部控制环境的措施：树立内控意识，革新组织机构，完善人事政策，加强成本控制，强化风险意识，发挥内部审计职能。