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AFLP（扩增片段长度多态性）是一种新的DNA分子标记技术，具有高效、快捷、稳定、可靠的特点。核桃是我国重要的干果树种，由于长期实生繁殖，后代变异大，造成单产低、商品质量混杂。我国是核桃的起源地之一，种质资源十分丰富，存在许多特异种质资源，但是对我国核桃属植物的遗传多样性的研究非常缺乏。为核桃的品种鉴定和种质资源保存提供依据，本研究在建立适合核桃的AFLP银染技术体系的基础上，构建了58份核桃供试样品的指纹图谱，并对其遗传多样性进行了分析。主要结果如下： 1．确定了适于AFLP分析的核桃基因组DNA提取为改良CTAB法，其提取液成份为：100 mmol／L Tris-HCl（pH 8.0），20 mmol／L EDTA，1.4 mol／L NaCl，2％ CTAB，3％ PVP40，50 mmol／L B-巯基乙醇，10 mmol／L Na2S2O5。粗提后的DNA经RNase除去RNA；苯酚-氯仿抽提一次，氯仿-异戊醇抽提两次，去除蛋白质，得到了浓度大，基本无降解，蛋白质和RNA去除彻底，纯度高、质量好的核桃基因组DNA。 2．通过对内切酶用量、酶切时间、连接时间、稀释倍数等的研究，建立了适于核桃分析的AFLP银染技术体系。在20 μL的酶切体系中，含基因组DNA450 ng，NEB Buffer2 2 μL，BSA 0.2 μL，EcoR Ⅰ（大连宝生物公司）和Mse Ⅰ（NEB公司）各3 U；37℃下酶切4 h；加入接头后，37℃连接10 h以上（或过夜）；连接产物稀释5倍后进行预扩增；预扩增产物稀释5倍后再进行选择性扩增；加10 μL Loading buffer，95℃变性10 min，立即冰浴；在6％变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳分析；银染法检测PCR产物。 3．从64对引物组合中筛选出10对多态性高、条带清晰、分布均匀的引物组合用于材料分析，共扩增出可统计条带560条，平均每对引物扩增带数为56条。其中多态性条带527条，占94.11％。根据材料间的特征带和差异带，建立了58份供试材料（46个核桃品种，8个河北核桃类型，4个核桃楸类型）的AFLP指纹图。 4．应用离差平方和法对10对引物扩增的560条谱带进行聚类分析，建立了58份供试材料的AFLP树状图，结合各样品间的遗传距离（欧式距离）对其遗传多样性进行了分析，揭示了供试材料间遗传背景的相似性及复杂性，为核桃的品种鉴定和产权保护，提供了理论依据。