如今环境污染越来越严重，水资源紧缺问题愈益突出，如何才能有效地保护水资源已提上了人们的议程。森林作为陆地生态系统的主体，在水源涵养方面发挥着巨大的作用。在水资源短缺的今天，如何能使森林更好的发挥水源涵养方面的作用成为了人们关心的话题。　　为了更快捷、更准确的识别出低功能水源涵养林，对低功能水源涵养进行及时有效的改造，本文通过分析森林水源涵养功能的内涵和表现形式，分析了影响森林水源涵养功能的初始指标，使用综合评价的方法筛选出需要的指标，然后使用层次分析的方法对森林水源涵养功能指标进行权重的计算，最后计算出各种情况下小班的水源涵养能力的综合指数值，对这些综合指数值进行排序，从而区分出低功能的小班，之后专业人员可以对这些低功能小班进行再改造。　　本文采用C#和MATLAB相结合的方式对森林水源涵养功能评估系统进行构建，其中使用C#实现系统界面的设计，使用MATLAB对收集到的数据进行相应的处理。实现了森林水源涵养功能的定量评估和相关信息与模型的有效管理，能够为水源涵养林的经营提供理论依据。