【摘 要】
:
蛋白质-蛋白质之间相互作用在细胞功能的各个方面如新陈代谢和信号传导中起着至关重要的作用。对蛋白质相互作用的分子机制的研究表明蛋白质界面上小部分残基对结合自由能的
论文部分内容阅读
蛋白质-蛋白质之间相互作用在细胞功能的各个方面如新陈代谢和信号传导中起着至关重要的作用。对蛋白质相互作用的分子机制的研究表明蛋白质界面上小部分残基对结合自由能的贡献很大,并且它们对维持蛋白质的稳定起着积极的作用。鉴别蛋白质作用界面的热点残基对于药物设计和研究癌症具有非常重要的意义。目前,通过生物实验技术来发现热点残基的方法,因其代价高不能被广泛的应用,因此,需要利用机器学习的方法来研究热点残基预测的问题。本文提出了一种可靠的热点残基预测的方法。针对每个残基,本文提取108种序列、结构和残基的微环境特征(包括传统的特征以及本文中提出的伪疏水性特征)。然后利用两步特征选择法,包括最小冗余最大相关性算法和穷举法,选择出最佳的3个特征。本文利用支持向量机来构建模型。和其他预测方法比较,本文的预测结果是最好的,F1和MCC分别达到了0.70和0.46。预测结果表明,通过本文的方法选取的3个特征比那些传统的特征更加有效,同时表明,结构和物理化学方面的特征是区分热点残基的重要特征。
其他文献
当下是读图时代,人们周围存在着各种图像,这些图像以各自不同的特点影响着学生的审美标准.较之早年学生头脑中图片量匮乏的问题,当下各种参差不齐的图像对学生的审美标准的影
井间电磁测井技术可以“透视”上千米的岩石,寻找被注水绕过的油气层,识别地层油气水运移状态,绘制井间地层构造。该技术不仅可以从现有储层中增加石油产量,并且可能成为寻找新油
宜昌科普报是一张面向农村的地区科技小报。由于我们坚持“注重实用、讲求实效”的方针,踏踏实实地为农民服务,因而受到广大读者的欢迎,发行量达十五万份,本地区每五户农民
电阻抗层析成像技术(Electrical Impedance Tomography,EIT)是近年来发展起来的新型测量技术,由于该技术具有无辐射、非侵入、响应快、结构简单以及成本低廉等优点,在医学临
非刚性运动恢复结构技术利用物体二维图像序列的特征点观察数据,建立空间投影模型,估计出物体的三维结构和相关的运动参数。作为计算机视觉研究领域的一个重要方向,广泛应用
报纸编辑工作的特点之一是,需要编排版面。一般初学编辑的青年,往往一来就被版面吸引住,总想很快学会组版技术。几个月下来,能够初步画画版样了,又觉得这也没有什么了不起,
某报一篇报道10月3日郑州市投放鼠药灭鼠的消息,文字不多,标题赫然:郑州老鼠的丧钟昨敲响。细品此句觉得别扭错在那里呢? 从这个句子的表面看,“丧钟”应是全句的主语。因为
随着各种电力电子装置在电力系统、工业及家庭中的广泛应用,保护电网安全和低污染地利用电能资源成为日益关注的问题。为减少对交流电网的谐波污染,国内外推出了一系列限制电流
近年来,随着科学技术的迅猛发展,GPS,GIS,无线通讯,计算机等技术的日益成熟和紧密结合,促使了GPS&GIS导航服务业的产生。在此情况下,GPS&GIS导航电子地图的应用研究,理所当然
水稻育秧移栽已在全疆主要稻区推广,因而普遍提高了产量,大家都认为这是增加稻米产量的有效措施.但个别地区也发生了一些问题.一九六五年,我们在温宿蹲点推广水稻插秧,得到