基于网络药理学探究中药丹参、三七治疗心血管疾病的作用机制

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心血管疾病已经成为现代社会最普遍的致死因素之一,它属于复杂性疾病,传统的单靶点高选择性的药物显示出了治疗效果差、副作用大等弊端,需要在整体性、系统性的层面进行新药的研发。我国传统的活血化瘀中药在防治心血管疾病中取得了良好的疗效,具有多成分,多靶点,整体性的特点,然而其分子机制尚未阐明,药效物质基础也没有完全明确。近年来兴起的网络药理学为跨越中西医间的鸿沟架起了桥梁。网络药理学能够给药理学和新药研发工作者带来的启示是:要分析“疾病网络”,鉴定疾病网络中的“关键节点”并寻求扰动,从而重建生物网络的平衡。本研究运用网络药理学的研究思路和方法,利用中医药数据库以及其他生物信息数据库,构建中药三七、丹参的“疾病-基因-靶点-药物”的网络,分析和预测中药三七、丹参的有效成分与心血管疾病靶点的相互作用关系和潜在的作用机制,并将预测结果进行计算机模拟和实验验证,初步探讨三七和丹参治疗心血管疾病的作用机制。主要成果如下:基于网络药理学,对三七进行网络药理学的分析,一共筛选出人参皂苷rh2、槲皮素、β-谷甾醇等11个有效成分,作用于92个靶点,关联267个疾病信息,基因本体(GO)富集分析和KEGG信号通路分析表明多种生物富集功能和信号通路与动脉粥样硬化相关,三七治疗动脉粥样硬化的潜在机制可能是通过调节NF-kappa B信号通路、TNF信号通路等来发挥治疗动脉粥样硬化的作用。基于网络药理学,对丹参几个常见的活性化合物进行网络药理学的分析,一共垂钓出靶点126个,与心血管疾病相关的直接靶点100个,占比79.4%,对这100个靶点进行MCODE模块分析表明这些靶点种类多样,涵盖多种类型和疾病的治疗靶点,其中,与TF密切相关的靶点25个,再对这25个与TF密切相关靶点的GO和KEGG分析表明丹参可能通过调控TF和与TF相关的基因从而调控PI3K-Akt信号通路,雌激素信号通路,TNF信号通路等发挥治疗心血管疾病作用。采用分子对接技术,计算机模拟丹参这几个成分与心血管疾病的关键靶点TF与F7结合蛋白(PDB ID:4YLQ)的结合能力,结果显示所有筛选出的小分子化合物都对TF/F7蛋白有较强的结合活性,大多数小分子化合物可以通过氢键,范德华力,pi-sigma等作用力与TF/F7蛋白的氨基酸残基结合。采用荧光实时定量(RT-q PCR)实验验证丹参的几个与TF相关蛋白结合活性高的化合物对LPS刺激的单核细胞TF m RNA高表达的抑制情况。结果显示选取的四个成分在一定浓度下都可以抑制TF m RNA的表达,不同程度的调控TF的活性,提示丹参可能是通过调控TF基因的表达,进一步调节相关靶点蛋白和信号通路而达到治疗心血管疾病的目的,与网络药理学预测的结果一致。
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