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组蛋白去乙酰化酶(HDAC)与基因的转录活性有着密切关系,转录活跃区的核小体组蛋白呈高度乙酰化,而不活跃的染色质呈去乙酰化状态。组蛋白去乙酰化在基因转录、信号转导、个体发育、细胞增殖和分化中至关重要。本实验以15头南阳黄牛和37头西门塔尔牛为研究材料,以HDAC1基因为南阳牛和西门塔尔牛经济性状的候选基因,采用PCR-SSCP和DNA PCR产物直接测序等技术,检测了HDAC1基因3’-UTR、 Intron4-Intron5、Intron10-Intron11基因序列的单核苷酸多态性(SNP),并分析该基因多态性与南阳黄牛和西门塔尔牛经济性状的关联性,以期为西门塔尔牛和南阳黄牛新品系的培育及品种改良等提供理论参考,加速良种肉牛的繁育。本研究的主要实验结果如下：1.PCR扩增得到南阳黄牛和西门塔尔牛HDAC1基因的Intron4-Intron5250bp, Intron10-Intron11276bp和3’UTR非翻译区368bp的DNA片段。2.应用PCR-SSCP技术和PCR产物直接测序法,发现南阳牛和西门塔尔牛的HDAC1基因Intron4-Intron5片段中均没有核苷酸多态性位点。3.在南阳黄牛和西门塔尔牛群体中,HDAC1Intron10-Intron11的102bp处均存在A/G突变位点,为同义突变。南阳黄牛纯合子GG基因型频率最大,纯合子AA基因型最小；而在西门塔尔牛中,AG杂合子频率分别大于两种纯合子频率。在两种牛群中,G等位基因均占多数。将该核苷多态性位点与经济性状进行关联分析发现：AG基因型的南阳黄牛,腰角宽显著长于AA基因型个体(P<0.05),且该位点的显性效应也达到显著水平；西门塔尔牛中,AA基因型个体的背膘厚度性状低于GG和AG型个体,差异显著(P<0.05),该突变位点对背膘厚度指标的基因加性效应达到了显著水平(P<0.05)。4.南阳黄牛HDAC1的3’非翻译区存在两个突变,第50bp处A/C多态性位点,存在的两种基因型中AA型基因型频率大于AC型；第199bp处的T/C多态性位点,群体中也只存在两种基因型,且TT基因型频率大于TC型；在这两个SNP中,A核苷等位基因均占到80%左右。而在西门塔尔牛群体中,HDAC1基因3’非翻译区没有发现多态性位点。5.分析南阳黄牛3’端非翻译区A/C多态性位点与生长性状关联性发现：AC基因型个体在体长性状、体高和十字部高均都显著高于AA基因型个体(P<0.05),而T/C位点对南阳黄牛的生长性状无显著性影响。上述研究结果表明,HDAC1基因片段中的一些SNP位点对肉牛的生长和屠宰性状具有影响,可能是潜在的肉牛育种的分子标记。