自然资源和环境是人类社会生存、发展的自然物质基础。伴随着人口增加，资源加速消耗，环境的严重破坏，人类社会的持续发展面临严重的威胁。提高资源的使用效率、保护生态环境、促进经济社会可持续发展已成为当今世界共同关注的焦点问题。2009年12月12日国务院正式批复《鄱阳湖生态经济区规划》，标志着建设高层次的鄱阳湖生态经济区正式上升为国家战略。近年来，虽然江西省经济发展取得了巨大的成就，但同时在经济结构、资源、环境等方面也面临着一系列问题，正制约着鄱阳湖生态经济区经济的可持续发展。本文引入了生态效率理论，协调鄱阳湖生态经济区生态环境保护与经济发展。众所周知，效率指如何通过最少的投入，得到最大的回报，它是经济学的核心命题。生态效率是指以生态为前提的效率，其本质是节能减排。本文从效率评价角度出发，结合鄱阳湖生态经济区具体情况，并引入了德国、芬兰等发达国家的循环经济指标体系的建立经验，构建出一套衡量湖区生态效率指标体系。本文以生态经济学、循环经济学等学科的基本理论和方法为基础，将定性分析与定量分析相结合。同时，运用生态效率指标体系来分析湖区包含的38个县（市、区）生态效率状况，具有较强的地域针对性。运用数据包络分析(DEA)方法对湖区38个县（市、区）2005年至2010年进行生态效率评价，并根据生态效率的评价结果，提出有针对性的建议，为鄱阳湖生态经济区的生态效率可持续发展提供前期研究成果，提高鄱阳湖生态经济区生态及经济发展的科学性，并促进其生态及经济的良性发展。