本研究以普氏原羚为试验对象,采集野生普氏原羚草青期与草枯黄期新鲜粪便样本,运用高通量测序技术对其不同物候期肠道菌群多样性进行对比分析。在本研究中还设置了两组圈养普氏原羚,分别饲喂其硒缺乏饲料和硒添加饲料,在饲喂结束后采集其粪便样品提取总DNA进行高通量测序,探究补充硒元素对普氏原羚肠道菌群多样性的影响。试验结果如下:（1）普氏原羚肠道菌群以厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）为优势菌门,两者相对丰度之和可达90%,且有大量菌属被注释为未分类菌属（unclassified）。（2）草青期组样本Alpha多样性指数（除辛普森指数外）均低于草枯黄期组,且两组间艾斯指数、赵氏指数有显著差异（P<0.05）;Beta多样性分析则显示两组样本群落结构组成有显著差异（P<0.05）。（3）群落物种分类结果显示,草青期组普氏原羚肠道菌群以厚壁菌门（Firmicutes）为主导菌群,而草枯黄期组则以拟杆菌属（Bacteroides）为主导菌群。（4）草枯黄期组样本中其他次生代谢物的生物合成（Biosynthesis of Other Secondary Metabolites）、辅助因子和维生素的代谢（Metabolism of Cofactors and Vitamins）、糖的生物合成和代谢（Glycan Biosynthesis and Metabolism）、氨基酸代谢（Amino Acid Metabolism）和其他氨基酸的代谢（Metabolism of Other Amino Acids）相关功能基因的丰度均显著高于草青期组样本（P<0.05）。（5）饲喂补硒饲料的试验组各Alpha多样性指数（除辛普森指数外）均高于饲喂缺硒饲料的对照组,但无显著差异（P>0.05）;Beta多样性分析则表明试验组与对照组普氏原羚肠道菌群物种组成具有显著差异（P<0.05）。（6）试验组普氏原羚肠道拟杆菌属（Bacteroides）和颤杆菌属（Oscillibacter）相对丰度显著高于对照组（P<0.05）,且其肠道菌群碳水化合物转运和代谢（Carbohydrate transport and metabolism）相关功能基因的丰度显著高于对照组（P<0.05）。基于以上试验结果,得出结论如下:（1）普氏原羚肠道菌群主要由厚壁菌门和拟杆菌门组成,且有大量菌属无法进行分类鉴定。（2）普氏原羚不同物候期肠道菌群组成有显著差异,其草青期肠道菌群以厚壁菌门为主导菌群,而草枯黄期则以拟杆菌属为主导菌群,且草枯黄期普氏原羚肠道菌群在氨基酸代谢、糖代谢和糖合成等代谢活动更为活跃。（3）补充硒元素有提高普氏原羚肠道菌群多样性的趋势,可提高普氏原羚肠道菌群中拟杆菌属和颤杆菌属丰度,同时上调肠道菌群转运和代谢碳水化合物相关功能基因的表达。