中小型河流与人类生存环境质量好坏关系最为密切,也是极易受到人类活动干扰的水环境承载体,点源、面源污染直接影响其水环境质量与河流健康,开展河流水质达标治理,对周边人居环境质量的改善与提高至关重要。本论文针对清安河河段水体污染特点与水动力特性,运用河流健康模型对清安河健康指数进行评价,分析河段健康影响的主要因素;在此基础上基于MIKE11的对流扩散模块（AD）和水动力模块（HD）构建了清安河水质演化模型,应用该模型分析清安河的TP和氨氮分布状况。提出了河段沿线工业污染源与城镇生活污染源截污及农业面源污染源就地处理、提高污水处理厂排放标准、综合治理措施等3种不同治理方案,通过模型计算对比河段水质治理改善效果,为水质达标治理提供最佳方案。研究内容及主要结论如下:（1）利用HD模块建立研究河段水动力模型。对清安河河段进行一维河网水动力建模,采用2020年实测河段水深和流量数据,率定河床糙率参数;采用二污厂下游、淮安农校处断面实测资料对模型参数进行校正。模拟结果表明:二污厂下游水深的相对误差为3.92%;淮安农校流量的相对误差为1.19%。因此,本研究构建的清安河段的水动力模型模拟河段水动力学条件的误差较小,可为更进一步水质模型的建立提供动力学依据。（2）在清安河段HD模型基础上,采用对流扩散模型（AD）模拟河段水质演化,调整氨氮与总磷的衰减与纵向扩散系数,并利用二污厂下游、淮安农校断面实测数据对模型参数进行标定。模拟结果表明,二污厂下游断面氨氮、总磷平均相对误差分别为0.87%、2.56%,淮安农校断面氨氮、总磷平均相对误差分别为1.89%、3.25%,可见清安河段水质模拟演化计算的水质与实测值误差较小,AD模型较为准确。（3）利用MIKE11建立的水质模型对清安河沿线点源和非点源污染不同水质治理措施下的治理效果进行预测。根据清安河水质改善目标,经模型模拟预测,方案3治污效果明显好于其它两种方案。方案3最大可使平水期河段氨氮浓度平均减少了10.42mg/l,降幅达到64.9%,总磷浓度平均减少0.37mg/l,降幅为52.6%;可使丰水期河段氨氮浓度平均减少了 7.01mg/l,降幅达到73.1%,总磷浓度平均减少0.75mg/l,降幅为64.4%。平水期模拟河段氨氮、总磷达Ⅳ类水要求的最大长度占全长分别为86%和21%,丰水期模拟河段氨氮、总磷达Ⅳ类水要求的最大长度占全长分别为82%和0%。研究结果可为清安河流域的河段水污染防治提供技术支持,为河流综合治理工程的决策提供参考和依据。