传统分类学和分子系统学关于鹀科鸟类的系统发育研究仍存在争议。东北地区共分布18种鹀,其中几种鹀之间的亲缘关系尚未明确。本文基于线粒体DNA (mtDNA)中的Cytochrome b基因的部分序列(770bp),以及核基因内含子β-Fibrinogen intron7基因序列(948bp),对鹀科(Emberizinae)的鹀属(Emberiza)、铁爪鹀属(Calcarius)、雪鹀属(Plectrophenax)18种鹀进行了系统发育分析。利用两基因的数据集分别构建了Bayes树和ML树,同时将两基因数据集联合构建Bayes树和ML树。通过比较分析,发现两基因联合构建的基因树支持率高于两基因单独构建的基因树,并依据两基因联合构建的Bayes树和ML树进行了分析。东北地区18种鹀分为3大支系。第一支系中铁爪鹀(Calcarius lapponcius)与雪鹀(Plectrophenax nivalis)聚为一支最早分化出来；第二支系中栗耳鹀(Emberiza fucata)最先分化出来,栗斑腹鹀(Emberiza jankowskii)与灰眉岩鹀(Emberiza cia)聚为一支,并与三道眉草鹀(Emberiza cioides)形成姐妹关系,栗斑腹鹀晚于三道眉草鹀及白头鹀(Emberiza leucocephalos)分化出来,该结果与此前几位学者结果不同,他们构建的系统发育树中栗斑腹鹀早于三道眉草鹀分化出来,从分化时间顺序看,作者认为栗斑腹鹀、白头鹀及三道眉草鹀存在杂交的可能性；第三支系中栗鹀(Emberiza rutila)、田鹀(Emberiza rustica)及灰头鹀(Emberiza spodocephala)三者之间亲缘关系较近,三种鹀是18种鹀中最晚分化出来的；并确定了小鹀(Emberiza pusilla)与黄胸鹀(Emberiza aureloa)之间较近的亲缘关系；黄眉鹀(Emberiza chrysophrys)与白眉鹀(Emberiza tristrami)形成姐妹关系；红颈苇鹀在第三分支内最早分化出来,不同于国内学者的研究结果,本论文结果支持芦鹀(Emberiza schoeniclus)与苇鹀(Emberiza pallasi)的亲缘关系较苇鹀与红颈苇鹀(Emberiza yessoensis)近的观点。