白细胞介素-33对肝癌细胞干性影响及其单核苷酸多态性对肝癌易感性的研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lipengzhangchinese
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1.白细胞介素-33对肝癌细胞干性影响的研究目的白细胞介素-33(interleukin-33,IL-33)作为促炎因子,通过结合其受体致癌性抑制基因2(Suppression of Tumorigenicity 2,ST2),参与了炎症,过敏性疾病,组织修复,肿瘤等多种疾病生理过程,然而它在肝癌中的作用还不明确。本研究利用The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库分析IL-33m RNA在肝癌及其癌旁组织中的差异表达,临床病理参数相关性和其潜在的调控基因;探讨IL-33对肝癌细胞的肿瘤干性的影响。这将为肝癌的诊断及治疗提供新的医学依据和理论基础。方法1.IL-33在肝癌中的表达和预后分析从肿瘤基因图谱TCGA数据库(https://cancergenome.nih.gov/)下载肝癌(Liver Hepatocellular Carcinoma,LIHC)样本的表达谱测序数据及临床数据,数据格式为FPKM,并使用R软件与TCGA数据库进行全面整合的分析,分析IL-33 m RNA在癌旁组织和肝癌组织中的表达差异,通过Kaplan-Meier曲线及单/多因素Cox分析IL-33与肝癌患者的生存期的相关性。同时使用基因集富集分析(Genes Enrichment Analysis,GSEA)方法来分析Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)数据库从而预测IL-33对肝癌的调控基因。2.IL-33对肝癌细胞的干性影响的研究采用体外成球实验来判断单个肝癌细胞在合适的条件培养基中是否具有自我更新的能力。采用实时定量PCR方法分别检测经IL-33刺激后肝癌细胞的肿瘤干性基因NANOG、NOTCH3、SOX2、OCT-3、NOTCH1、NOTCH2的表达情况,以探究IL-33对于肝癌细胞的干细胞活性相关基因的影响。使用CCK8实验来评估IL-33在5-氟尿嘧啶(5-Fluorouracil,5-Fu)化疗药物对肝癌细胞增殖作用中的影响。结果1.IL-33在肝癌中的表达和预后分析经分析发现IL-33 m RNA在肝癌组织中表达低于癌旁组织(p<0.05),且高表达IL-33的肝癌患者生存期长于低表达组(p<0.05),通过单因素Cox分析发现IL-33是肝癌患者的保护因子(HR=0.796,p<0.05),但多因素Cox分析发现IL-33不是肝癌患者的独立预后因子。同时也发现IL-33与肿瘤干细胞活性相关的TGF-β信号通路及JAK/STAT信号通路。2.IL-33对肝癌细胞的干性影响的研究(1)IL-33抑制肝癌细胞的体外成球能力用不同浓度的人重组IL-33刺激人肝癌Hep G2细胞、HUH-7细胞、SMMC-7721细胞,在浓度为10ng/ml的人重组IL-33刺激下,相比于对照组,其成球数量显著减少,而且随着浓度的增加,肝癌细胞的成球大小也减少(p<0.05)。(2)IL-33抑制肝癌细胞的肿瘤干性基因的表达在IL-33的刺激下,人肝癌Hep G2细胞、HUH-7细胞、SMMC-7721细胞的干性基因NANOG、NOTCH3、SOX2、OCT-3、NOTCH1、NOTCH2的表达水平下调(p<0.05)。(3)IL-33促进5-Fu对肝癌细胞的凋亡能力经IL-33(25ng/ml)刺激的人肝癌Hep G2细胞、HUH-7细胞、SMMC-7721细胞,相对于对照组,在5-Fu浓度为50μg/ml时的实验组,肝癌细胞对5-Fu的耐药性显著下降(p<0.05),即IL-33促进5-Fu诱导的Hep G2细胞、HUH-7细胞、SMMC-7721细胞的凋亡。结论1.IL-33m RNA在肝癌组织中为低表达,IL-33是肝癌患者的保护因子,但不是肝癌患者的独立预后因子;IL-33的表达对肝癌的进展有抑制作用。2.IL-33可能抑制肝癌的肿瘤干细胞活性从而抑制肝癌的发生发展。2.CD44,IL-33,ST2单核苷酸多态性与肝癌易感性的关系研究目的探讨IL-33/ST2及肿瘤干细胞标志分子CD44基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的易感性相关危险因素及临床相关指标的关系。方法使用病例对照的研究方法,纳入广西地区565例肝癌患者和我院561例健康体检者。SNa Pshot方法被采用于所选的基因进行基因分型。使用群体遗传学哈-温平衡(Hardy-Weinberg,HWE)定律检验纳入的病例组和对照组人群是否来自同一个孟德尔群体。使用非Logistic回归分析基因的单核苷酸多态性与肝癌之间的易感性并用它校正年龄、性别等混杂因素影响后计算算相对危险因素(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)。采用卡方检验来分析所选基因多态性与单核苷酸多态性分型在临床病理特征亚组中的分布是否存在差异。结果通过分析发现CD44 rs187115及ST2 rs3821204GG位点多态性与发生肝癌风险增加有关(p<0.05),IL-33基因rs1929992位点多态性与HCC风险无相关性。结论CD44 rs187115及ST2 rs3821204GG位点多态性与发生肝癌风险增加有关
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