【摘 要】
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目的 分析云南省手足口病（Hand, foot and mouth disease, HFMD）病例柯萨奇病毒A组4型（Coxsackievirus A4,CVA4）分离株基因特征。方法 在云南省7个市州采集2018-2021年HFMD病例粪便标本，进行肠道病毒RNA提取、VP1区基因扩增、序列测定和基因型别鉴定；构建CVA4分离株与基因库中参考株系统进化树，分析核苷酸和氨基酸相似性。结果 从28
【基金项目】
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国家科技重大专项基金项目（2017ZX10103010）；
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目的 分析云南省手足口病（Hand, foot and mouth disease, HFMD）病例柯萨奇病毒A组4型（Coxsackievirus A4,CVA4）分离株基因特征。方法 在云南省7个市州采集2018-2021年HFMD病例粪便标本，进行肠道病毒RNA提取、VP1区基因扩增、序列测定和基因型别鉴定；构建CVA4分离株与基因库中参考株系统进化树，分析核苷酸和氨基酸相似性。结果 从28 565例HFMD病例粪便标本中获得13株CVA4,其中2018年1株、2019年1株、2020年6株、2021年5株；C2基因亚型11株、C4基因亚型2株。C4和C2基因亚型之间核苷酸、氨基酸平均相似性分别为85.77%、93.27%;与原型株HighPoint相比，C2基因亚型核苷酸、氨基酸平均相似性分别为84.51%、93.27%,C4基因亚型分别为84.44%、93.78%。结论 2018-2021年云南省HFMD病例CVA4的优势流行株为C2基因亚型；需继续加强CVA4分子流行病学监测。
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