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讨论了在复杂背景条件下采用EMCCD实现光子计数成像的处理策略，提出了一种双重阈值滤波方法并通过实验验证了其有效性。根据EMCCD的成像模型，将EMCCD的输出图像表示为光子事件、偏置噪声和伪光子噪声事件的集合。通过采集多幅EMCCD的输出图像，将光子事件检测问题转化为标准的二元假设检测问题。利用贝叶斯判决，可以得到光子事件检测的最佳检测法则，使光子事件的误判代价达到最小，从而检测出光子事件及其空间分布特征。通过实验对比可以发现：提出的方法明显优于普通的累加积分方法，适合生物微光检测等超低照度条件下的成像领域。