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隐孢子虫为体积微小的球虫类寄生虫，广泛寄生于多种脊椎动物体内，可引起一种以腹泻为主要临床表现的人兽共患性原虫病。近年来，隐孢子虫病的检出率逐年增高，已被列为世界最常见的6种腹泻病之一。在国外，隐孢子虫已被列为艾滋病患者的常规检查项目。本文主要介绍近年来隐孢子虫在形态学、分子生物学等方面分类学研究的进展。