基因间长链非编码RNA RP11-488L18.10在胆管癌中的表达及其与预后的关系

来源 :临床肝胆病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zaifasoftware

【摘要】

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目的筛选胆管癌(CCA)中关键基因间长链非编码RNA(lincRNA),并研究其表达与患者预后的关系。方法CCA表达量和临床数据来自于人类癌症基因组图谱(TCGA)。数据集GSE107943 CCA表

【作者】

：

谭峥嵘丰大利张清

【机构】

：

宜昌市第二人民医院,宜昌市第二人民医院

【出处】

：

临床肝胆病杂志

【发表日期】

：

2020年5期

【关键词】

：

胆管肿瘤 RNA 长链非编码预后 bile duct neoplasms RNA long untranslated prognosis

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目的筛选胆管癌(CCA)中关键基因间长链非编码RNA(lincRNA),并研究其表达与患者预后的关系。方法CCA表达量和临床数据来自于人类癌症基因组图谱(TCGA)。数据集GSE107943 CCA表达数据获取自高通量基因表达数据库(GEO)。利用R软件进行差异性基因分析,确定肿瘤和正常样品之间显著差异性表达的lincRNA;筛选关键lincRNA。使用受试者工作特征曲线(ROC曲线)分析基因表达对CCA的诊断意义。使用Kaplan-Meier生存曲线分析患者预后。基因富集分析分析显著富集分通路。实时荧光

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