基于第二代测序的大鳞副泥鳅生长相关SNP标记的开发

来源 :江苏农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:acy333
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  摘要:大鳞副泥鳅是鳅科重要经济鱼类,通过Illumina HiSeq 2000测序平台对2个大鳞副泥鳅样本的转录本进行了高通量测序,其中AB2011M-1是群体中生长较快的10尾鱼的混合转录本,AB2011M-2是生长较慢的10尾鱼的混合转录本。通过对以上2个混合转录本的测序,分别获得了65 536和80 786个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)突变;对2个测序样本进行表达差异的比较,获得了39个表达差异基因。随机选取120个位点设计引物,进行验证分析,共获得16个有效的多态性标记。 全文查看链接   1.5SNP分析 全文查看链接   [8]Saiki R K,Bugawan T L,Horn G T,et al. Analysis of enzymatically amplified beta-globin and HLA-DQ alpha DNA with allele-specific oligonucleotide probes[J]. Nature,1986,324(6093):163-166. 全文查看链接   [24]Pardo B G,Fernández C,Millán A,et al. Expressed sequence tags (ESTs) from immune tissues of turbot (Scophthalmus maximus) challenged with pathogens[J]. BMC Veterinary Research,2008,4:37. 全文查看链接
其他文献
摘要:以水培吊兰为研究材料,采用发光二极管(light emitting diode,LED)调制不同光谱能量分布,研究不同光谱能量分布对水培吊兰叶色、植株质量以及生根的影响。结果表明,红光处理和红蓝光2 ∶1组合处理均能明显促进吊兰生长,白光处理、蓝光处理和黄光处理的效果次之,绿光对促进吊兰茎叶、水生根生长也有一定的效果。  关键词:吊兰;生长;光谱;能量分布;水培  中图分类号: S682.3
摘要:温度对小麦白粉病影响试验的结果表明,此病害适宜发生的温度为15~20℃,低于10℃或高于25℃对该病有明显抑制作用。    注:本文中所涉及到的图表、注解、公式等内容请以PDF格式阅读原文 本文为全文原貌 未安装PDF浏览器用户请先下载安装
摘要:采用酶活力测定法,比较桑粉虱6种寄主植物(桑树、黄瓜、烟草、菜豆、马铃薯、番茄)田间种群羧酸酯酶、乙酰胆碱酯酶和谷胱甘肽-S-转移酶活性的变化。结果表明,6种植物粉虱种群乙酰胆碱酯酶活力马铃薯种群最高,烟草最低,且桑树种群与其他种群相比差异显著或极显著;羧酸酯酶的活性是番茄种群最高,菜豆种群最低,桑树粉虱种群与黄瓜和马铃薯种群相比差异不显著,与番茄种群相比差异显著或极显著,与烟草和菜豆种群相
摘要:对菟丝子、淫羊藿水提液进行分离纯化,并将水提液加入大鼠精液冷冻保护剂中,对大鼠附睾尾部精子进行冷冻保存,并评估冷冻前后精子活率指数,采用伊红染色评估精子畸形率。结果表明:添加菟丝子、淫羊藿水提液的冷冻保护剂可以提高解冻后精子活率指数。菟丝子、淫羊藿水提液在大鼠精液冷冻保存过程中有一定的保护作用。  关键词:淫羊藿;菟丝子;大鼠;附睾精子;精子活率指数  中图分类号: R321.1 文献标志码
传统的课堂教学学生兴趣不浓,参与度不高,教师怕学生不理解,一味多讲多练,教师教得苦,学生学得累,教学效果事倍功半. 新课程提倡学生自主探究、合作学习,广大教师都在积极探索如何改革课堂教学模式. 近几年来,我校根据素质教育的理念和新课程体系的要求,结合本校的实际情况,探究出了“以问题为主线,学生为主体,发展为主旨”的课堂教学模式——“问题链导学”教学模式,其核心是以教材为依据,并根据学生的认知规律精
摘要:山东省济南市邢家渡沉沙池是黄河下游邢家渡引黄灌区上的一个主干沉沙池,前后运行近30年,于2002年停止使用,灌区沉沙池约204 hm2的土地彻底废弃,已成为济南市区风沙的源头。根据废弃沉沙池沙化土地开发指导思想和功能定位,按照废弃沉沙池湿地综合治理的策略和特色,研究制定废弃沉沙池沙化综合治理和土地开发利用模式,为小流域治理开发、水土保持规划奠定基础和决策依据,对区域开发、环境治理有重要的现实
摘要:为综合利用水稻秸秆,提取水稻秸秆纤维素,采用稀碱/H2O2和稀酸溶液依次对水稻秸秆进行处理。结果表明,大部分半纤维素和木质素在稀碱处理过程中得以脱除,残余的少量半纤维素和木质素则在稀酸处理过程中被进一步脱除。当水稻秸秆经过5% KOH/H2O2和pH值为3.5的乙酸溶液处理后,半纤维素和木质素的脱除率分别为91.8%和97.4%,提取的纤维素纯度达90.2%。  关键词:酸碱处理;水稻秸秆;
摘要:研究不同播期及播种量对稻茬小麦扬麦16群体生长及产量的影响。结果表明:越冬期与拔节期小麦株高随着生育期的推迟逐渐降低;各时期小麦株高变化趋势一致,随着播种量(基本苗)增加,株高均呈降低趋势。随着播期推迟,小麦叶面积降低。同一播期处理下,拔节期至抽穗期,小麦单茎干物质量逐渐增加。不同播期对小麦产量影响较大,播期太早或太晚都不利于产量形成。11月8日播期处理下,小麦产量最高。在同一用种量(基本苗
摘要:研究牙鲆变态期间核酸、总蛋白及其比值的变化,并确定其与生长的关系。结果显示,DNA浓度在22~32日龄保持相对稳定,在32~34日龄急剧升高,在36日龄达到最高。RNA浓度在24日龄升至峰值,在32日龄降至最低,之后呈先升高再下降的趋势。总蛋白浓度在22~29日龄呈升高趋势,之后先降低再上升。DNA、RNA含量及总蛋白含量在变态期间均保持先升高后降低再升高的趋势,在32~36日龄快速增长。R
摘要:以13个不同生育期组美国大豆标准品种为参照,初步确定辽宁省沈阳地区大豆品种生育期组划分标准的参考范围,并对沈阳地区大豆主栽品种、新近选育的品种(系)、国家和省级大豆品种区域试验对照品种进行生育期分组。结果表明,在沈阳地区参试品种中,除辽豆32号属于Ⅱ生育期组外,其余品种均属于Ⅲ生育期组。  关键词:沈阳;大豆品种;生育期组;划分  中图分类号: S565.104文献标志码: A文章编号:10