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2009年4月7日，新医改方案正式公布之时，家住墨西哥克萨特佩克镇的4岁男孩埃德加·赫尔南德斯患了一场不同寻常的感冒。十多天后，他被追认为第一例甲流（时称猪流感）患者。2009年4月25日，世界卫生组织发出甲型H1N1流感疫情通报。此后，甲型H1N1病毒随着高度发达的人流网络传遍世界，并于2009年5月11日扣开中国大门。2009年的甲流阻击战，是对我国非典后建立起来的突发公共卫生应急体系的一次实战检验。