【摘 要】
：
目的 初步筛选与宫颈鳞状细胞癌和食管鳞状细胞癌发生相关的差异甲基化标志物.方法 采用Illumina Infinium HumanMethylation450 Bead Chips(甲基化450k芯片)技术分别检测并分析8例宫颈鳞状细胞癌和8例食管鳞状细胞癌及其相应癌旁组织的DNA甲基化谱,筛选差异甲基化基因;结合基因本体(Gene Ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)Pathway分析差异甲基化
【机 构】
：
新疆医科大学基础医学院病理学教研室,乌鲁木齐 836001;新疆医科大学第一附属医院妇科;新疆医科大学全科医学学院,第七临床学院
论文部分内容阅读
目的 初步筛选与宫颈鳞状细胞癌和食管鳞状细胞癌发生相关的差异甲基化标志物.方法 采用Illumina Infinium HumanMethylation450 Bead Chips(甲基化450k芯片)技术分别检测并分析8例宫颈鳞状细胞癌和8例食管鳞状细胞癌及其相应癌旁组织的DNA甲基化谱,筛选差异甲基化基因;结合基因本体(Gene Ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)Pathway分析差异甲基化基因生物学功能,并通过UALCAN数据库和GEPIA数据库对差异基因进行验证.结果 与癌旁组织相比,宫颈鳞状细胞癌和食管鳞状细胞癌中分别检测出29505个和54009个差异甲基化位点,两种肿瘤组织的共有差异位点5421个.这些共有甲基化差异位点主要位于启动子、gene body和3′UTR等基因功能区,基于这些共有甲基化位点,鉴定出相关基因2041个.结合GO功能注释分析显示在生物进展过程注释类别中,这些基因主要富集于信号传导、细胞黏附、胚胎骨骼系统形态发生;在分子功能注释类别中,主要集中于基因序列特异性结合、基因序列特异性结合转录因子活性、钙通道活性的调节;在细胞组分注释类别中,主要以质膜、质膜的整体组成、基底膜为中心.KE GG通路分析发现差异甲基化基因与黏着斑、癌症信号通路、细胞外基质受体相互作用和肌动蛋白细胞骨架调节有关,并筛选得到ITGA6基因可以作为以上2种肿瘤发生相关的候选基因;利用UALCAN数据库和GEPIA数据库分析显示ITGA6基因在2种肿瘤中高表达.结论 ITGA6基因在鳞状细胞癌的形成中发挥重要作用,可作为诊断鳞状细胞癌的重要标志物.
其他文献
目的 研究核糖体蛋白侧柄亚单位P0(ribosomal protein lateral stalk subunit P0,RPLP0)对急性髓系白血病(AML)细胞增殖和凋亡的调控作用.方法 用qRT-PCR和Western blot检测健康者(n=15)和AML患者(n=30)骨髓标本、AML细胞系(THP-1)及PBMC细胞中RPLP0的表达.用Lipofectamine 2000分别将RPLP0的短发夹RNA(shRNA-RPLP0组)、shRNA阴性对照(shRNA-NC组)、过表达RPLP0的质
目的 筛查脑出血大鼠中与Ho-1基因相关的microRNAs.方法 将SD大鼠分为脑出血模型组(n=6)与假手术组(n=6).采用局部注射血栓构建脑出血模型,假手术组大鼠脑部注射生理盐水.HE染色以及神经行为学评分评定模型是否成功建立.检测各组大鼠脑组织HO-1及其相关miRNA(miR-331-3p、miR-298-5p、miR-221-3p、miR-187-5p、miR-7a-5p、miR-3557-3p、miR-673-5p、miR-330-5p、miR-6331、miR-29b-5p、miR-21
目的 探讨胃癌组织中PTEN、RUNX3基因甲基化与幽门螺杆菌感染的关系.方法 采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测100例胃癌患者的癌组织及其对应的癌旁组织中PTEN、RUNX3基因启动子甲基化情况.所有受检者行胃镜前均进行13 C尿素呼气试验检测幽门螺杆菌感染情况.结果 胃癌组织标本中PTEN基因甲基化率高于癌旁组织,差异有统计学意义(40％vs 4％,P<0.01).RUNX3基因甲基化率高于癌旁组织,差异有统计学意义(64％vs 8％,P<0.01).胃癌组织中PTEN、RUNX3基因甲基化
仅通过废气涡轮增压器和废气锅炉回收的船舶余热利用方式经济性较低.余热发电能够有效提高船舶余热利用率,提高船舶能效,减少船舶碳排放,是船公司实现“碳中和、碳达峰”目标的有效途径.在电加热器逐渐推广应用的背景下,通过安装或改造船舶余热发电装置将是未来船舶余热利用的重要方式.
文章结合实际项目,主要探讨了项目分包工程成本管理的措施,包括工程实施前控制分包成本、分包结算进行成本总结、做好分包商管理风险转移,最终该项目取得了良好的成本管理效果,可为类似项目提供参考.
目的 观察伏立康唑对快速延迟整流钾通道(hERG)及电压门控钠通道(Nav1.5)表达和功能的影响.方法 分别用浓度为0,2.5,5,10,50μmol/L伏立康唑干预稳定表达hERG通道蛋白及Nav1.5通道蛋白的HEK-293细胞24 h,Western blot检测hERG及Nav1.5的表达水平.用5μmol/L伏立康唑干预稳定表达Nav1.5的HEK-293细胞,分别干预0,2,4,8,16,24 h,Western blot检测Nav1.5的表达水平.用0,5,10μmol/L伏立康唑干预稳定
目的 探讨在不使用免疫抑制剂的情况下,十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)脱细胞方法用于气管异种移植的可行性.方法 采用健康家猪9只,体质量50～60 kg,雌雄不限.健康成年比格犬9只,体质量11～14.5 kg,雌雄不限.将获取的9段家猪气管随机分为3组:1％SDS处理组(气管管腔内浸泡1％SDS去黏膜),3％SDS处理组(气管管腔内浸泡3％SDS去黏膜)和3％SDS内外处理组(整个气管管腔内外均浸泡于3％SDS去黏膜).3组处理后的气管,在不使用任何免疫抑制剂的情况
近年来,公司承接的工程多涉及炸礁工程,本文结合青岛港前湾港区泛亚码头疏浚工程炸礁施工实施过程中的现场监测资料,对水下钻孔爆破产生的振动进行分析,确定安全药量,为类似工程提供借鉴.
目的 探索不同年龄小鼠脾脏和外周血免疫细胞、细胞因子的变化.方法 24只雄性C57BL/6J小鼠分为幼年(1月龄)组7只、青年(2月龄)组7只、中年(12月龄)组7只、老年(17月龄)组3只.分别用流式细胞术和ELISA检测小鼠脾脏和外周血免疫细胞(CD3-CD19+B细胞、CD3+CD4+T细胞、CD3+CD8+T细胞、CD3-CD49b+NK细胞、CD11 b-CD11 c+DC细胞、CD11b+Ly6CmedLy6G+粒细胞、CD11b+Ly6ChiLy6G-单核细胞)的比例和细胞因子(IL-1β、
为了能够在船舶火灾应急时刻提高人员撤离效率,最大限度的保障船员在应急疏散撤离过程中的人身安全,针对目前船舶脱险通道指示仅仅局限于传统的蓄光自发光型指示标志的情况,在不断推动船舶智能化发展的今天,通过现有陆地大型智能集成化方案,结合现有船舶火灾监控与报警系统的联动模式,从SOLAS公约,FSS规则,IMO相关决议,国际标准化组织ISO的相关技术要求和国内相关法律法规,以及相关国家标准上探讨船舶智能脱险通道指示系统的可行性,并给出基于船舶火灾监控与报警系统的智能疏散指示系统的可行性方案.