十足目（Decapoda）方蟹总科（Grapsoidea）系统发育关系长期以来缺乏定论。为探讨该总科内部亲缘关系及其与线粒体基因排序之间的相关性,研究以方蟹科（Grapsidae）白纹方蟹（Grapsus albolineatus）为代表种,测定其线粒体基因组全序列,全长为15577 bp,包含13个蛋白编码基因, 22个tRNA基因, 2个rRNA基因和1个控制区。基因组碱基组成为33.4%A、12.0%G、20.6%C和34.0%T,具有明显的AT偏向性（67.4%）。除ATP8和ND1以GTG作为起始密码子外,其余蛋白编码基因均以ATN作为起始密码子;除COII和Cyt b以T作为不完全终止密码子外,其余基因均以TAN作为终止密码子。亮氨酸（Leu）和半胱氨酸（Cys）分别是使用频率最高（15.28%）和最低（0.81%）的两种密码子。除tRNA-Ser1缺少DHU臂外,其余tRNA均能形成典型的三叶草结构。基于13个蛋白编码基因的核苷酸序列同时构建了方蟹总科的贝叶斯树（BI）和最大似然树（ML）,两种方法构建的系统发育树扑拓结构一致,均显示所有方蟹科（Grapsidae）种类聚在一起,其中白纹方蟹与同属的细纹方蟹（G. tenuicrustatus）的亲缘关系最近;相手蟹科（Sesarmidae）与怪方蟹科（Xenograpsidae）形成姐妹群关系后与地蟹科（Gecarcinidae）聚为一支,三者与方蟹科互为姐妹群,弓蟹科（Varunidae）则为相对独立的一支。研究还比较分析了方蟹总科（Grapsoidea）的线粒体基因排序情况,并发现方蟹总科基因重排和系统发育有着明显的相关性。研究系统地阐述了方蟹总科的系统发育关系,为更好地理解基因重排和系统发育之间的关系提供了理论支撑。