【摘 要】
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利用生物信息学手段,从NCBI中db EST数据库获取大量的石斛属（Dendrobium Sw.）EST序列,对SNP与EST的数量及拼接结果之间的关系、SNP碱基置换的偏好性进行了分析。采用DNASTAR软
【基金项目】
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广西自然科学基金项目（2016GXNSFAA380093）,广西亚热带作物研究所基本科研业务费专项资金项目（桂热研201602）.
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利用生物信息学手段,从NCBI中db EST数据库获取大量的石斛属（Dendrobium Sw.）EST序列,对SNP与EST的数量及拼接结果之间的关系、SNP碱基置换的偏好性进行了分析。采用DNASTAR软件中的SeqMan程序对获取的16 183条石斛EST序列构建叠连群,得出2 267个叠连群,长度计628 444 bp,发现342个叠连群共含有1 083个候选SNP位点。经统计分析SNP位点平均出现频率为0.17%,平均580.28个bp含有1个SNP位点,每个叠连群含有3.25个SNP位点。不同
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