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１９９５－０４～１９９６－０４对杭州西湖水体中微生物生理群生态分布的研究结果表明：①好气性异养型细菌平均达２．０６×１０３个／ｍｌ。放线菌、霉菌、酵母菌的量较少，分别为３５个／ｍｌ、２４个／ｍｌ和２个／ｍｌ。②从大肠菌群指数来看，西湖水体还受着生活污水的污染，其中岳湖和西里湖污染程度还相当严重。③纤维素分解菌平均为２５个／ｍｌ，氨氧化细菌为４５３个／ｍｌ，亚硝酸氧化细菌５８５个／ｍｌ，硝酸还原菌３．２×１０３个／ｍｌ，脱氮菌４３个／ｍｌ，有机磷分解菌８个／ｍｌ。④纤维素分解菌、氨化细菌、氨氧化细菌、硝酸还原菌在夏季较少，冬季反而较多，它们与温度的相关系数分别为－０．５４６７＊＊，－０．４５０６＊，－０．４３６８＊和－０．４５０２＊；而亚硝酸氧化菌和脱氮菌与温度的相关关系不明显。⑤自养型的硝化细菌在水质较好的小南湖、北里湖分布广泛，而异养型微生物在富营养化严重的岳湖、西里湖密度较大。⑥假单胞菌属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）、芽胞杆菌属（Ｂａｃｉｌｕｓ）、肠细菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）是西湖水体中的优势菌群。