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探讨环状RNA(circRNA)在银屑病发病中的作用。
方法分离、培养15例银屑病患者皮损及15例健康对照皮肤间充质干细胞(MSC),用流式细胞仪及多向分化法进行鉴定。用RNA测序法检测circRNA表达,并进行详细的生物信息学分析。挑选7个差异表达的circRNA构建circRNA-microRNA相互作用网络,从中挑选3个与其相关的microRNA进行qRT-PCR验证。银屑病患者组和对照组qRT-PCR验证结果采用两独立样本t检验。
结果RNA测序结果显示,共检测到6 323个circRNA,其中3 227个为本实验首次发现。与对照组相比,患者组中有129个circRNA呈差异表达,其中123个表达上调,6个表达下调。挑选7个差异circRNA进行circRNA-microRNA相互作用预测,显示与这7个circRNA关系密切的银屑病相关microRNA,包括miR-17-5p、miR-30e-5p、miR-142-3p/5p、miR-369-3p、miR-184、miR-4490、miR-654-3p、miR-423-5p等。qRT-PCR也证实,这7个差异circRNA在患者组也表达上调。与对照组相比,挑选的3个microRNA在银屑病皮损中低表达(t值分别为3.993、3.217、2.918,均P < 0.05)。
结论银屑病皮损MSC circRNA表达异常,并可能参与了银屑病发病。