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利用分散量的数学理论，提出了基于最小分散增量的蛋白质序列辨识方法．通过多种特征联合对蛋白质序列进行编码，并建立基于最小分散增量的分类器MID_OMP，应用于革兰氏阴性细菌外膜蛋白序列辨识．在数据集上的Jackknife测试中，MID_OMP辨识外膜蛋白和α螺旋跨膜蛋白的准确率达到95．7％，辨识外膜蛋白和球状蛋白的准确率达到91．0％：在14个细菌基因组内挖掘结果显示，MID_OMP具有较高的敏感性和特异性．预测结果的可信度明显优于另外一种OMPs挖掘工具TMBETA—GENOME．