【摘 要】
：
目的 基于加权基因共表达网络(WGCNA)分析复方红豆杉胶囊治疗肺腺癌(LUAD)的有效成分及作用机制.方法 使用TCMSP数据库、BATMAN数据库筛选复方红豆杉胶囊的活性成分及治疗靶点;使用TCGA数据库及GEO数据库对LUAD的表达谱数据进行WGCNA分析,筛选LUAD的共表达模块.将复方红豆衫胶囊活性成分治疗靶点、TCGA数据库及GEO数据库中相关性差异最大的基因模块进行相互映射,取交集获得复方红豆杉胶囊治疗LUAD的加权共表达基因;使用R语言绘制加权共表达基因的药物—化合物—靶点图,并对加权共表
【机 构】
：
广州中医药大学第一临床医学院,广州5100062;广州中医药大学第二临床医学院
论文部分内容阅读
目的 基于加权基因共表达网络(WGCNA)分析复方红豆杉胶囊治疗肺腺癌(LUAD)的有效成分及作用机制.方法 使用TCMSP数据库、BATMAN数据库筛选复方红豆杉胶囊的活性成分及治疗靶点;使用TCGA数据库及GEO数据库对LUAD的表达谱数据进行WGCNA分析,筛选LUAD的共表达模块.将复方红豆衫胶囊活性成分治疗靶点、TCGA数据库及GEO数据库中相关性差异最大的基因模块进行相互映射,取交集获得复方红豆杉胶囊治疗LUAD的加权共表达基因;使用R语言绘制加权共表达基因的药物—化合物—靶点图,并对加权共表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析.使用R语言对TCGA数据库的临床数据进行生存分析,绘制Kaplan-Meier单变量生存分析图,筛选复方红豆杉胶囊治疗LUAD的核心靶基因,并通过HPA数据库对该核心靶基因进行免疫组化分析,验证其在正常组织及LUAD组织中是否有差异.结果 共得到复方红豆杉胶囊活性成分141个,作用靶点356个.TCGA数据库中共得到15个基因共表达模块,GEO数据库中共得到5个基因共表达模块,其中TCGA数据库中的绿松石色模块(正常样本r=0.77,LUAD样本r=-0.77,P=9E-119)及GEO数据库中的绿松石色模块(正常样本r=0.88,LUAD样本r=-0.88,P=5E-22)相关性差异最明显,分别包含了6587、649个基因.将复方红豆杉胶囊活性成分治疗靶点、GEO数据库绿松石色基因、TCGA数据库绿松石色基因取交集,共得到复方红豆杉胶囊治疗LUAD的加权共表达基因14个,分别为LDLR、FOS、IL6、CAV1、TUBB3、TUBB6、MCL1、CA2、JUN、SLC6A4、CD36、ALDH1A1、MAOB、TFAP2C.加权共表达基因的药物—化合物—靶点图显示,红豆素A和紫杉碱为复方红豆杉胶囊治疗LUAD的主要活性成分.GO功能分析显示,复方红豆杉胶囊治疗LUAD的主要生物过程为有机羟基化合物转运、细胞对氧化应激的反应、对脂多糖的反应等,主要细胞成分为内吞囊泡膜、内吞囊泡、膜筏等,主要分子功能为低密度脂蛋白颗粒受体活性、一氧化氮合酶结合、脂蛋白颗粒受体活性等;KEGG通路分析显示,复方红豆杉胶囊治疗LUAD主要通过致病性大肠杆菌感染、朊病毒病、苯丙胺成瘾等通路发挥作用.Kaplan-Meier单变量生存分析图显示,CAV1基因为复方红豆杉胶囊治疗LUAD的核心靶基因(P<0.009).HPA数据库中免疫组织化学染色显示,CAV1在肺正常组织中染色中等,在LUAD组织中无染色.结论 复方红豆杉胶囊治疗LUAD的主要的活性成分为红豆素A和紫杉碱,核心靶基因为CAV1,其可通过有机羟基化合物的转运、调节低密度脂蛋白颗粒受体的活性等方式与致病性大肠杆菌感染信号传导通路协同发挥治疗作用.
其他文献
市政道路对于城市发展而言非常重要,如果道路出现裂缝、坑洼等问题时均会影响到行人、车辆,甚至还会为其带来一定安全隐患.因此,为了能够有效避免、减少上述问题的发生与出现,则有必要做好前期质量管控工作,以期提高市政道路安全质量与水平,从而为行人、车辆安全行驶提供有力保障.基于此,本文以下将市政道路施工中的质量管理存在的主要问题进行展开分析与探讨,从而为更好地开展道路施工质量管理工作提供参考借鉴.
随着全球化的发展,跨国并购成为企业向外拓展的重要发展方式.近年来,我国的经济发展不断提高,国内企业跨国并购的案例呈上升发展趋势,并购的绩效也逐渐引起企业的重视.本文将在传统单纯的财务指标角度对并购绩效研究的基础上,利用平衡计分卡多角度多指标的评价思想进行跨国并购绩效分析,即以海尔并购通用家电为例从财务、客户、内部业务流程、学习和成长四个维度评价跨国并购绩效,突破了传统方法.通过海尔并购通用家电这一经典跨国案例带给我们的结论,希望对往后企业海外并购绩效得到一些启示.
目的 观察新型冠状病毒(新冠病毒)Delta变异株感染患者外周血早期实验室检查指标及疫苗接种对新冠病毒Delta变异株感染患者的保护作用,为疫情防控提供参考.方法 2021年11月成都本土疫情中诊断为新冠病毒Delta变异株感染的年龄>18岁的新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)非重型患者25例,记为实验组,22例在感染前接种了新冠病毒疫苗,3例(其中2例80岁以上)未接种疫苗.另纳入2020年1—2月在成都市公共卫生临床医疗中心隔离治疗的年龄>18岁的新冠肺炎非重型患者71例,记为对照组.所有患者于入院当天或第
目的 观察褪黑素腹腔注射对急性脑梗死大鼠神经细胞损伤凋亡的改善作用,并探讨其机制.方法 60只SD大鼠随机分为假手术组、模型组、褪黑素低剂量组、褪黑素中剂量组、褪黑素高剂量组、阳性对照组,每组10只.除假手术组外,其他5组建立急性脑梗死模型.造模成功后开始给药,褪黑素低剂量组、褪黑素中剂量组、褪黑素高剂量组分别给予褪黑素5、10、15 mg/kg,假手术组与模型组给予相同体积的生理盐水,阳性对照组给予尼莫地平15 mg/kg.给药方式均为腹腔注射,每日1次,共给药7 d.给药结束后24 h,采用Longa
目的 观察轻度认知功能障碍(MCI)患者肠道菌群丰度变化及健脾补肾复方还少丹治疗的效果.方法 选择MCI患者24例,随机分为观察组和对照组各12例;另选同期健康志愿者12例为健康对照组.采用16S rRNA技术分析MCI患者与健康对照组肠道菌群丰度差异.观察组予以健脾补肾方还少丹及八段锦治疗,对照组仅予以八段锦治疗,两组疗程均为12周;采用蒙特利尔认知评估量表(MOCA)、简易精神状态量表(MMSE)、中医证候积分进行疗效评价,观察治疗安全性;采集MCI患者新鲜粪便,测序观察两组治疗前后肠道菌群丰度变化,
随着国民经济的快速发展,城镇化进程不断加快,建筑工程数量规模连年增长,社会生产生活对建筑需求量也呈爆发趋势,建筑工程已逐步成为当前经济架构下的重要组成部分.现代建筑工程环节众多,技术工艺复杂,工程管理的重要性尤为突出.此外,很多建筑企业在建筑工程实施阶段投入大量的财力物力,如果不能快速高效完工,企业的经济效益将难以实现快速增长.在此背景下,建筑工程项目进度管理工作成为各类建筑企业的关注要点.
目的 观察产后盆底功能障碍(PFD)初产妇分娩后血清基质金属蛋白酶-1(MMP-1)、骨桥蛋白(OPN)、结缔组织生长因子(CTGF)水平变化情况,并分析其对初产妇产后PFD的预测效能.方法 初产妇产后发生PFD的患者71例,记为PFD组.其中子宫脱垂者31例、压力性尿失禁者40例,分别采用MRI分度标准对子宫脱垂、压力性尿失禁患者进行分度.另选择同期产后复查无PFD的初产妇105例为对照组.采用酶联免疫吸附试验检测两组患者血清MMP-1、OPN、CTGF水平.以单因素分析中差异有统计学意义的指标为自变量
目的 观察转染过表达WW域的氧化还原酶(WWOX)质粒对胆囊癌细胞株GBC-SD迁移、侵袭能力的变化,并探讨其机制.方法 胆囊癌细胞株GBC-SD分为实验组、NEG组、空白对照组,实验组转染WWOX过表达质粒,NEG组转染空载质粒,空白对照组不做处理.采用细胞划痕实验测算各组细胞迁移率,以细胞迁移率表示细胞迁移能力.采用Transwell实验测算各组穿膜细胞数,以穿膜细胞数表示细胞侵袭能力.采用实时荧光定量PCR法检测各组细胞中WWOX、P73、E-cadherin、Vimentin mRNA,采用Wes
目的 观察抑制分离缺陷基因3(PARD 3)表达的宫颈癌细胞系SiHa增殖、凋亡、侵袭及迁移能力变化,并探讨其可能作用机制.方法 取对数生长期SiHa细胞分为siRNC组、siRNA1组及siRNA2组,分别用骨架质粒、PARD 3siRNA1(抑制PARD3基因表达)、PARD 3siRNA2(抑制PARD3基因表达)腺病毒真核载体转染.采用qRT-PCR法检测三组转染后细胞PARD3、JAK2 mRNA.培养24、48 h时采用Western Blotting法检测三组PARD3蛋白,培养48 h时检
简述了乌鲁木齐地下综合管廊建设的发展战略目标,介绍了综合管廊的发展现状,规划布局原则以及相关的综合管廊的技术标准.