【摘 要】
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Due to the large-scale spread of COVID-19, which has a significant impact on human health and social economy, developing effective antiviral drugs for COVID-19 is vital to saving human lives. Various
【机 构】
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Institute of Medical Intelligence, School of Computer and Information Technology, Beijing Jiaotong U
【基金项目】
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partially supported by Beijing Natural Science Foundation (No. M21012); National Key Research and Development Program of China (No. 2017YFC1703506, No. 2018AAA0100302);
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Due to the large-scale spread of COVID-19, which has a significant impact on human health and social economy, developing effective antiviral drugs for COVID-19 is vital to saving human lives. Various biomedical associations, e.g., drug-virus and viral protein-host protein interactions, can be used for building biomedical knowledge graphs. Based on these sources, large-scale knowledge reasoning algorithms can be used to predict new links between antiviral drugs and viruses. To utilize the various heterogeneous biomedical associations, we proposed a fusion strategy to integrate the results of two tensor decomposition-based models(i.e., CP-N3 and Compl Ex-N3). Sufficient experiments indicated that our method obtained high performance(MRR=0.2328). Compared with CP-N3, the mean reciprocal rank(MRR) is increased by 3.3% and compared with Compl Ex-N3, the MRR is increased by 3.5%. Meanwhile, we explored the relationship between the performance and relationship types, which indicated that there is a negative correlation(PCC=0.446, P-value=2.26 e-194) between the performance of triples predicted by our method and edge betweenness.
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