【摘 要】
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植物CIPK蛋白激酶家族(CBL-interacting protein kinase)是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族,该家族成员通过与上游的CBL蛋白(Calcineurin B-like protein)互作,形成CBL-CIPK信号系统,参与调控植物的生长发育和逆境胁迫响应过程.早期研究发现,拟南芥AtCIPK24分别通过与AtCBL4和AtCBL10互作,激活下游靶蛋白的活性,应对高盐胁迫.本研究前期从林烟草中获得了 1个与拟南芥AtCIPK24同源的基因Nsyl-rnCIPK24a,但与其互作
【机 构】
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中国农业科学院烟草研究所,农业部烟草生物学与加工重点实验室,青岛,266101;吉林大学动物科学学院,长春,130012;中国农业科学院烟草研究所,烟草行业烟草基因资源利用重点实验室,青岛,26610
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植物CIPK蛋白激酶家族(CBL-interacting protein kinase)是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族,该家族成员通过与上游的CBL蛋白(Calcineurin B-like protein)互作,形成CBL-CIPK信号系统,参与调控植物的生长发育和逆境胁迫响应过程.早期研究发现,拟南芥AtCIPK24分别通过与AtCBL4和AtCBL10互作,激活下游靶蛋白的活性,应对高盐胁迫.本研究前期从林烟草中获得了 1个与拟南芥AtCIPK24同源的基因Nsyl-rnCIPK24a,但与其互作的CBL家族成员及该激酶的具体功能尚不清楚.因此,本研究对林烟草CBL家族成员进行了全基因组预测;利用RT-PCR方法克隆CBL家族成员,并对其基因结构、蛋白保守结构域及组织表达情况进行了分析;通过酵母双杂交试验鉴定与NsylCIPK24a互作的林烟草CBL家族成员.结果表明,林烟草中共预测并克隆获得12个CBL家族成员;NsylCBL4、NsylCBL5、NsylCBL9和NsylCBLl0 4个成员可与NsylCI-PK24a在酵母中产生互作.推测烟草中可能也存在与拟南芥类似的应对盐胁迫的CBL-CIPK响应路径.本研究为解析林烟草NsylCIPK24a的功能、加深人们对烟草中CBL-CIPK调控通路的理解提供了研究数据.
其他文献
以4年生健康西洋参根际土壤(healthy ginseng soil,HS)和患根腐病西洋参根际土壤(root rot gin-seng soil,RS)为研究对象,采用基于气相色谱-飞行时间质谱联用技术(GC-TOF-MS)的代谢组学方法分析根际土壤差异代谢产物.RS vs HS组共筛选到13个具有显著性差异(P＜0.05)的代谢产物,其中包括9种有机酸、3种糖类和1种萜类.与HS组相比,RS组中二十四烷酸、棕榈酸、巴豆酸、苯甲酸、油酸、十七烷酸、壬二酸、水杨酸和儿茶酸的水平显著升高(P＜0.05),而
为探究灯盏花Eb14-3-3基因表达特征,本研究从灯盏花基因组数据库中克隆了拟南芥同源基因灯盏花14-3-3v序列信息,利用生物信息学方法对该蛋白的功能和活性位点进行预测,通过荧光定量PCR分析在非生物胁迫条件下该基因的表达变化.结果表明,Eb14-3-3的ORF序列长804 bp,编码267个氨基酸;该蛋白的分子量和理论等电点分别为65 296kD和5.16.Eb14-3-3蛋白序列中富含磷酸化位点,为一个非分泌型蛋白,并且在其结构中无跨膜结构域.二级结构分析显示有156个α-螺旋,47个片层延伸,9个
植物糖类转运蛋白家族中GLT (Glucose transporter)是介导葡萄糖跨膜运输的重要载体.开展苦荞葡萄糖转运蛋白(FtGLT)的生物信息学研究,可为进一步探索FtGLT调控生长发育与产量形成提供科学参考.通过基因注释与序列比对分析,在苦荞转录组测序数据库中筛选到6个GLT同源基因.FtGLT序列在2167～9707 bp间,编码94～558个氨基酸残基.FtGLT蛋白间序列的一致性达到43.44％,说明苦荞FtGLT蛋白序列相对保守.除FtPinG68303.01外,其余5个FtGLT蛋白可
茉莉花茶属于中国的一种特种茶,深受消费者喜爱,具有广阔的市场前景.茉莉花作为茉莉花茶窨制的主要原材料,其质量与香气决定着茉莉花茶质量的优劣,茉莉花的香气独特且浓郁,其释香与花瓣的开放相伴发生.本研究通过对茉莉花开放前后的全长差异性消减文库进行构建获得了 131个差异表达基因,并且从差异表达基因中筛选香气合成相关的基因,进一步从筛选结果中分离出催化苯甲醇合成的香气释放相关基因JsBEFBT,其开放阅读框全长1 404 bp,编码467个氨基酸,JsBEBT在茉莉花活体条件下开放过程和茉莉花瓣离体养护过程的表
为揭示茶树被茶饼病危害诱导的防御反应机制,本研究选择抗病和感病茶树品种为材料,通过转录组测序和数字表达谱分析茶树叶片被茶饼病危害前后的基因表达差异.结果 显示,共筛选出差异表达基因974条,其中共有的为122条,抗病品种中特异364条,感病品种中特异的为488条.对差异表达基因进行分析发现,茶饼病危害主要影响了茶树体内代谢途径、内质网蛋白质加工、次生代谢产物的生物合成、植物病原相互作用、植物激素信号转导途径、淀粉与蔗糖的代谢、苯丙醇生物合成等通路中关键基因的表达水平,这些差异基因包括抗病蛋白基因(R pr
PIN(PIN-FORMED)作为生长素输出载体,在生长素极性运输过程中起重要作用,但是目前在甘蔗中还没有相关研究.本研究结合甘蔗割手密种基因组数据、非生物胁迫和生物胁迫下的甘蔗栽培种转录组数据,通过生物信息学分析技术,对甘蔗割手密种PIN基因进行了基因家族鉴定、基因结构及功能分析.分析结果表明,甘蔗割手密种中共有22个SsPIN基因,其中包括15对串联重复基因,启动子包含16类顺式元件,外显子和内含子数目差别明显,分布于14条染色体.SsPINs氨基酸长度在305～791之间,其编码蛋白质分子量在33.
为了更好地利用甘蔗野生种蔗茅(Erianthus fulvus Ness.)的抗逆相关基因,并为转基因甘蔗抗逆育种提供可靠的候选基因.本研究利用电子克隆和RT-PCR的方法在蔗茅野生种\'蔗茅99-2\'中克隆到一个干旱诱导表达基因,并命名为FfNAC (GenBank登录号:MT499790).生物信息学分析表明,FfNAC基因ORF长度为765 bp,共编码254个氨基酸,具有一个保守的NAM结构域.编码的蛋白以无规则卷曲和α-螺旋为主,没有信号肽,具有多个磷酸化位点,没有跨膜结构.本研究为深
GRF转录因子参与多种生长发育过程,包括根、茎、叶和花的发育等.本研究基于荔枝转录组测序结果,共鉴定出22个GRF基因并分析其蛋白理化性质、系统进化、基因结构、miRNA靶基因和组织表达分析.结果表明,22个GRF蛋白的大小为72～246 aa,分子量为8 055.41～250 929.9 Da,等电点为4.96～10.44.大部分GRF蛋白为亲脂蛋白并主要定位于细胞核中.系统进化分析将其分为6类,相较于水稻,荔枝与拟南芥GRF的亲缘关系更近.22个GRF基因均含有WRC或QLQ结构域,同一类基因含有相似
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