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高校自然科学类课程与思想政治理论课协同育人是推进“课程思政”建设、满足新时代高校课程改革和教学需求,实现全方位、多角度、宽领域协同育人的有效手段和重要保障。高校自然科学类课程与思想政治理论课协同育人是指二者在思想上“立德同向”,在行动上“树人同行”,二者实现协同育人具有深刻的政策依据、目标依据和使命依据。可以从克服“去意识形态化”倾向、打造共同参与课程团队、搭建资源共建共享平台、创新课程考核评价方式四个方面确保二者同向同行、协同育人的有效实施。