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《果树学报》为中国科学院“中国科学引文数据库来源期刊(核心库)”,“中文核心期刊”“中国科技核心期刊”。被美国的《化学文摘》(CA)、《剑桥科学文摘》(CSA).俄罗斯的《文摘杂志》(AJ),日本的《科学技术文献速报》(CBST)和英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)等20余种国内外重要检索刊库收录,已成为国内外有影响的学术期刊之一。