序列拼装程序的并行化研究与实现

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基因序列拼装是分子生物研究的重要环节之一。随着DNA序列的快速增长,如何提高基因序列拼装的速度,成为当前基因组研究的重要问题。为充分利用SMP以及集群的资源,在找出Phrap程序的瓶颈后,分别在SUN Enterprise3500及集群上将串行的Phrap程序进行了并行化。论文论述实现并行拼接程序的机理和性能。
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