【摘 要】
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谷胱甘肽-抗坏血酸(ascorbate-glutathione,AsA-GSH)途径在植物抗氧化过程中具有重要作用.本研究基于忍冬转录组数据,利用生物信息学的方法对AsA-GSH途径中的LAPX、RRM、G6PD
【机 构】
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山西农业大学生命科学学院,山西太谷030801
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谷胱甘肽-抗坏血酸(ascorbate-glutathione,AsA-GSH)途径在植物抗氧化过程中具有重要作用.本研究基于忍冬转录组数据,利用生物信息学的方法对AsA-GSH途径中的LAPX、RRM、G6PD、NRT和PGD调控基因进行相关分析.结果表明:LjLAPX、LjG6PD和LjNRT为不稳定的疏水蛋白,LjRRM和LjPGD为稳定的疏水蛋白.二级结构均为混合型结构,α-螺旋作为多肽链中的大量结构元件分布于整个多肽链中.利用同源建模法分析了蛋白质的三维结构.跨膜结构预测显示LjRRM、LjG6PD和LjPGD无跨膜区,LjLAPX和LjNRT分别有2个和11个跨膜区域.KEGG分析了AsA-GSH途径的代谢调控网络.基因表达分析发现,整个低温过程中LjLAPX、LjRRM、LjG6PD、LjNRT和LjPGD基因均差异表达,共同调控GSH和AsA的水平,提高植物的抗性.RT-qPCR试验进一步证明了转录组数据的可靠性.
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