目的探讨中医药治疗甲状腺功能减退症组方规律。方法检索清华同方、中国知网、维普、万方数据库中治疗甲状腺功能减退症的方剂,对入选的中药处方进行术语规范化等处理,建立EXCEL表,应用开源软件包R3.3.0对数据进行关联规则、聚类分析方药配伍规律;分析甲状腺功能减退症方剂的组方规律。结果筛选出203个处方,200味中药进行分析,确定处方中各种药物频次,出现频率较高的中药为白术、黄芪、茯苓、甘草、附子、山药、熟地黄、当归、山茱萸等,药物之间的关联规则,演化得到核心组合49个,强关联规则与聚类分析结果提示以白术、黄芪、附子、肉桂、甘草、茯苓、桂枝、熟地黄、当归、山茱萸等核心药物组成的薯蓣丸、四逆散等为治疗甲状腺功能减退症的基本新处方,组新方7个。结论开源软件包R3.3.0对甲状腺功能减退症中医药研究提供了方法学支持,通过对药物关联规则、聚类的分析,揭示了治疗甲状腺功能减退症组方用药规律,为临床优化处方、提高疗效提供参考依据。