【摘 要】
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对甜荞根转录组的SSR位点进行了统计分析,并设计了引物。利用Misa软件在长度大于200 bp的55392条Transcripts中,共检索到3906个SSR位点,出现频率为1/1.709 kb。随着Transcripts长度的增加,含SSR序列的比例和SSR分布频率均增加。单、二和三核苷酸重复类型共占SSR位点总数的95.80%,其中单核苷酸重复数量最多,占48.13%;(A)n、(AG)n和(AAG)n分别是单、二和三核苷酸重复的优势基
【机 构】
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贵州师范大学,贵州省信息与计算科学重点实验室
【基金项目】
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国家现代农业产业体系荞麦育种岗位科学家专项(CARS-08-A4),贵州省科技支撑项目(黔科合ZC[2019]2298),贵州省荞麦种质资源保育及创新重点实验室建设基金(黔教合KY[2017]002)。
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对甜荞根转录组的SSR位点进行了统计分析,并设计了引物。利用Misa软件在长度大于200 bp的55392条Transcripts中,共检索到3906个SSR位点,出现频率为1/1.709 kb。随着Transcripts长度的增加,含SSR序列的比例和SSR分布频率均增加。单、二和三核苷酸重复类型共占SSR位点总数的95.80%,其中单核苷酸重复数量最多,占48.13%;(A)n、(AG)n和(AAG)n分别是单、二和三核苷酸重复的优势基
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