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有机物质的分解和利用过程是其在一定的温度和湿度条件下的无害化过程，在科学的有机肥料加工条件下，有机物质发酵腐熟完全，养分容易被作物吸收利用，其中的病菌、虫、卵等有害物质也在高温条件下被杀灭。而如果不经过加工或者腐熟不完全就施入土壤，容易造成烧苗、病虫害发生以及作物酸害等危害，同时也造成养分的损失以及环境的污染等问题。因此，必须重视有机肥施用前的无害化处理过程。