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针对分布式数据库多表查询速度慢的问题，提出一种改进的分布式数据库查询优化遗传算法。利用条件采样的方法，维持种群的多样性，防止算法陷入局部最优解；利用马氏链模型优化变异算子，确定变异算子当前状态下的最优取值，进行交叉和变异操作，找出最优查询执行计划。仿真结果表明，改进算法能在较短时间内找到最优的查询执行计划，加快查询速度，提高查询效率。