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通过对粗糙脉孢菌（Neurospora crassa）小RNA的cDNA文库筛选及基因组分析，鉴定了3个U3snoRNA基因，命名为NcU3A、NcU3B和NcU3C，这3个基因表达的U3snoRNA的大小分别为262，270和275nt．同时，Northern杂交还揭示出不同大小的U3snoRNA剪切变体，表明U3 snoRNA的表达存在复杂的转录后加工．粗糙脉孢菌U3snoRNA都具有物种间保守的与18SrRNA配对的功能区；NcU3A及其剪切变体还具有一段过去没有报道的与26SrRNA互补的反义序列